More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2926 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.46 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 211 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.2 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.32 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.85 
 
 		 211 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  44.71 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  46.08 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 207 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  45.89 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  44.61 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  42.51 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  42.01 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.09 
 
 		 210 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.45 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 215 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.41 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  42.27 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.01 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  43.19 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.51 
 
 		 210 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.18 
 
 		 242 aa  157  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.63 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  44.71 
 
 		 218 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.48 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  39.42 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  41.95 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>