More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2340 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 213 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.26 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.99 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.51 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.55 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.11 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.2 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.89 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.48 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.12 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.12 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  41.59 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  41.59 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 209 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.73 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.58 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.2 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.44 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  44.34 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  45.5 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.19 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.51 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 250 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  43.26 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.45 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.6 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  39.23 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  41.55 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 242 aa  148  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  41.33 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>