More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3337 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.25 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 		 226 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.97 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.32 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  52.51 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  54.88 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.04 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  52.13 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.89 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 226 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  53.18 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.93 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  55.19 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  50.68 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.7 
 
 		 234 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.44 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.04 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.42 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  52.8 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.39 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.6 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.91 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.35 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  49.53 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.9 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.9 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  52.83 
 
 		 217 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.84 
 
 		 221 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.16 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  48.91 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 225 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.12 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.9 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  46.67 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.34 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  49.52 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.13 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.48 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  49.08 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.67 
 
 		 226 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.06 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  48.6 
 
 		 220 aa  188  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 217 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 220 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  47.44 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  50 
 
 		 215 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.42 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 		 218 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.88 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 223 aa  185  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.75 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  49.76 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 217 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.29 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>