More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1071 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  74.88 
 
 		 211 aa  312  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.5 
 
 		 212 aa  258  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  63.11 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.61 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 212 aa  241  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.78 
 
 		 209 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.87 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.25 
 
 		 211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.29 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  58.65 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  57.35 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  58.25 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  58.45 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  57.84 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.12 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  57 
 
 		 210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  54.41 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  57.69 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 207 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  57.42 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.56 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.74 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.83 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  52.88 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.96 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.39 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 213 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  49.26 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.06 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.87 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  48.34 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.96 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.15 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.07 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  46.01 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.78 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 210 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  45.93 
 
 		 218 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  45.07 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.06 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.5 
 
 		 230 aa  174  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 236 aa  174  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 242 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  45.71 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  45.71 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  45.71 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  45.71 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  45.71 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  45.24 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  42.03 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  45.71 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>