More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0606 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 212 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.06 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.08 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.39 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.47 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  62.07 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  60.98 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  62.93 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  62.8 
 
 		 212 aa  234  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.49 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.24 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.31 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.75 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 222 aa  224  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.32 
 
 		 210 aa  224  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.83 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.56 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  57.71 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  57.07 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  56.1 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.22 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  53.88 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 222 aa  187  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.83 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  48.34 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.2 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.24 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.85 
 
 		 226 aa  177  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.69 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.28 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  45.09 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.99 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.03 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  45.75 
 
 		 218 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  47.95 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 231 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  48.54 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  46.54 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  48.11 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  45.54 
 
 		 230 aa  171  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  44.65 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  44.91 
 
 		 242 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.51 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  47.87 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  49.26 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 217 aa  167  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.59 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.6 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.66 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.18 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.63 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>