More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1284 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.86 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.03 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.8 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.88 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  45.89 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  41.31 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  45.63 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  41.01 
 
 		 232 aa  157  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  42.65 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  39.72 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 303 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 250 aa  154  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.09 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.34 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 210 aa  151  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 238 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 253 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  40.78 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  41.2 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  41.75 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  41.75 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  41.75 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  41.75 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  40.09 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>