More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3231 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  72.55 
 
 		 212 aa  298  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 212 aa  241  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.43 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.37 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  38.32 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  38.32 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  38.83 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  38.32 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  37.2 
 
 		 209 aa  142  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  38.07 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  39.63 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  38.5 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.5 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  37.09 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  36.19 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  34.15 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.47 
 
 		 209 aa  137  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  36.67 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 253 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  38.57 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  39.63 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  37.38 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  38.83 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 227 aa  134  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>