More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4922 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 206 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.95 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  61.27 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.22 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  61.27 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 213 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  56.86 
 
 		 207 aa  217  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.56 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.96 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  52.68 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.19 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.45 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.33 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.43 
 
 		 211 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  53.4 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.71 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.51 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  51.96 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.85 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  48.37 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  49.04 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  49.51 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  47.91 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.85 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.51 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.34 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  44.65 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  42.25 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 242 aa  171  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.92 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  43.41 
 
 		 218 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  41.83 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  41.83 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.31 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  41.83 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  47.14 
 
 		 220 aa  167  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.12 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.51 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  46.05 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.79 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  48.04 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  46.7 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.79 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.25 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>