More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0228 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 212 aa  281  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.86 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.65 
 
 		 235 aa  225  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.11 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  49.3 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  48.83 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  48.83 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  49.3 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  49.3 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  49.3 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  49.3 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  49.3 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  49.3 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.83 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  45.85 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  45.85 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  45.85 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  48.56 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.89 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.89 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  52.29 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.04 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 230 aa  174  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  48.15 
 
 		 230 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 250 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.54 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.05 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  45.02 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  45.02 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.03 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.34 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.34 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.4 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.26 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  46.26 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  47.34 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.83 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 224 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.39 
 
 		 239 aa  161  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  46.8 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 218 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.6 
 
 		 217 aa  160  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.79 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>