More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1936 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  100 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.02 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  60.49 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.68 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  56.73 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.29 
 
 		 222 aa  214  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.1 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.8 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.07 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.54 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.66 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.35 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.24 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  56.1 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.62 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.85 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  54.85 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.31 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.4 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.47 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.21 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.2 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  49.76 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.19 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  50.95 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  45.79 
 
 		 235 aa  160  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 225 aa  160  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.98 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  43.19 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.83 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.53 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  42.25 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 224 aa  151  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 253 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 224 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.27 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.52 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  47.09 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>