More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06630 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.67 
 
 		 214 aa  261  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  52.53 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  51.83 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 228 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  40 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  39.81 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  41.12 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 244 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  40.65 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.32 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.73 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  37.17 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  40.19 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>