118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0537 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.92 
 
 		 1535 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 1514 aa  3076    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.67 
 
 		 1451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.16 
 
 		 1453 aa  602  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  37.82 
 
 		 1407 aa  573  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.69 
 
 		 1512 aa  546  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1193 aa  377  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  34.39 
 
 		 847 aa  249  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  34.36 
 
 		 341 aa  103  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  38.04 
 
 		 1004 aa  94.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  30.77 
 
 		 344 aa  92.8  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  30.83 
 
 		 317 aa  92.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 454 aa  92.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 776 aa  92  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1762 aa  91.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  30 
 
 		 321 aa  89.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  41.77 
 
 		 456 aa  85.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  30.5 
 
 		 312 aa  84  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  28.79 
 
 		 321 aa  79.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 471 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1557 aa  78.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  30.04 
 
 		 339 aa  77.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  28.03 
 
 		 717 aa  76.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 508 aa  77  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28 
 
 		 445 aa  76.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  26.57 
 
 		 795 aa  73.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  25.31 
 
 		 812 aa  73.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.28 
 
 		 2182 aa  73.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  25.38 
 
 		 887 aa  72.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  31.82 
 
 		 993 aa  72  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 461 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  27.65 
 
 		 314 aa  68.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  26.67 
 
 		 334 aa  68.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.23 
 
 		 693 aa  66.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.81 
 
 		 1017 aa  65.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 1009 aa  65.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  29.81 
 
 		 1009 aa  65.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  27.05 
 
 		 990 aa  64.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.95 
 
 		 2171 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1170 aa  63.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  29.33 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  32.59 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  32.59 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  32.59 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  32.59 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  32.59 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  32.59 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  45.45 
 
 		 814 aa  62  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  31.85 
 
 		 368 aa  61.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  26.33 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.36 
 
 		 1710 aa  58.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 775 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  27.92 
 
 		 318 aa  58.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.91 
 
 		 997 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.6 
 
 		 725 aa  55.5  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 1075 aa  55.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  26.83 
 
 		 236 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1109 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  30.53 
 
 		 1202 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1182 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  25.52 
 
 		 809 aa  53.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  22.45 
 
 		 326 aa  53.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  45.9 
 
 		 998 aa  53.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3680  hypothetical protein  25.44 
 
 		 549 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  25.91 
 
 		 698 aa  53.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  25.62 
 
 		 402 aa  52.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  26.09 
 
 		 368 aa  52  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  29.03 
 
 		 506 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  34.31 
 
 		 557 aa  52  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 1066 aa  51.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 759 aa  52  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  36.43 
 
 		 483 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 		 999 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  32 
 
 		 162 aa  50.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.9 
 
 		 1489 aa  50.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  28.57 
 
 		 639 aa  50.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  26.36 
 
 		 1461 aa  50.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 		 1501 aa  50.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  21.88 
 
 		 376 aa  49.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1126 aa  49.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  26.79 
 
 		 401 aa  49.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 1087 aa  49.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.85 
 
 		 1215 aa  49.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  37.5 
 
 		 690 aa  48.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  45 
 
 		 769 aa  48.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  24.29 
 
 		 339 aa  48.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  45.21 
 
 		 853 aa  48.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1120 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1122 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 791 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1269  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1141 aa  47.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3723  hypothetical protein  25.05 
 
 		 511 aa  47.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4209  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.08 
 
 		 1618 aa  47.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  32.33 
 
 		 883 aa  47.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 		 933 aa  47.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 760 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 893 aa  47.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 962 aa  47  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  26.34 
 
 		 346 aa  47  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 935 aa  46.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>