79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1066 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  100 
 
 
1193 aa  2381    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.03 
 
 
1535 aa  416  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  40.71 
 
 
1514 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2149  hypothetical protein  38.06 
 
 
847 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.44 
 
 
1512 aa  285  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.56 
 
 
1212 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  34.37 
 
 
1736 aa  139  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  39 
 
 
607 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  27.56 
 
 
887 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.24 
 
 
1001 aa  99.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.11 
 
 
1109 aa  96.3  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  51.43 
 
 
717 aa  95.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  40 
 
 
756 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  34.12 
 
 
2239 aa  92.4  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  34.6 
 
 
772 aa  81.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  36.23 
 
 
897 aa  81.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  29.2 
 
 
1029 aa  79  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.09 
 
 
1243 aa  75.5  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  38.51 
 
 
1424 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  40.57 
 
 
1428 aa  72.4  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2916  hypothetical protein  46.43 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  47.66 
 
 
592 aa  72  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  35.44 
 
 
1802 aa  70.1  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30 
 
 
1073 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.8 
 
 
724 aa  70.1  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  35.59 
 
 
1321 aa  70.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  35.71 
 
 
616 aa  68.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  47.37 
 
 
691 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  33.67 
 
 
1303 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  31.93 
 
 
2169 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  30.95 
 
 
1626 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  43.12 
 
 
608 aa  61.6  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  36.28 
 
 
662 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.94 
 
 
1147 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.29 
 
 
601 aa  58.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  40.4 
 
 
868 aa  58.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.45 
 
 
721 aa  58.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 
596 aa  58.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  33.17 
 
 
2690 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  51.49 
 
 
884 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.37 
 
 
726 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  48.54 
 
 
586 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  31.09 
 
 
2002 aa  56.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40 
 
 
1035 aa  55.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  35.92 
 
 
950 aa  55.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  37.5 
 
 
593 aa  55.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 
663 aa  55.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3680  hypothetical protein  21.86 
 
 
549 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431002  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  28.19 
 
 
614 aa  55.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  34.23 
 
 
1236 aa  55.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2367  hypothetical protein  44.16 
 
 
1360 aa  55.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.574377  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.8 
 
 
823 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  46.15 
 
 
1077 aa  55.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1258  hypothetical protein  27.32 
 
 
561 aa  54.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  36.89 
 
 
674 aa  53.5  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4711  hypothetical protein  39.6 
 
 
996 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  43.43 
 
 
1131 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.96 
 
 
467 aa  52.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  32.81 
 
 
3802 aa  52  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  41.3 
 
 
2082 aa  52  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.9 
 
 
727 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3723  hypothetical protein  32.74 
 
 
511 aa  51.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0586  hypothetical protein  36.11 
 
 
568 aa  50.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  30.49 
 
 
1310 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  40 
 
 
597 aa  48.5  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  33.9 
 
 
644 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  29.01 
 
 
1151 aa  47.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0519  hypothetical protein  37.5 
 
 
456 aa  47.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.69 
 
 
1661 aa  46.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0341  hypothetical protein  26.82 
 
 
427 aa  46.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156991  hitchhiker  0.00506023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  31.07 
 
 
699 aa  46.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.45 
 
 
771 aa  45.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  40.91 
 
 
580 aa  45.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  30.13 
 
 
1879 aa  45.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  32.38 
 
 
332 aa  45.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.98 
 
 
1251 aa  45.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.86 
 
 
835 aa  45.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  37.68 
 
 
1478 aa  44.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0506  hypothetical protein  34.48 
 
 
456 aa  44.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.912357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>