42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0444 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  100 
 
 		 586 aa  1170    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  69.23 
 
 		 1243 aa  346  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  70.04 
 
 		 691 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  42.76 
 
 		 884 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  43.06 
 
 		 788 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  43.46 
 
 		 753 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  46.83 
 
 		 710 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  56.6 
 
 		 504 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  47.85 
 
 		 918 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  47.83 
 
 		 663 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  43.59 
 
 		 597 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.76 
 
 		 651 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  37.18 
 
 		 802 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1746  hypothetical protein  34.09 
 
 		 184 aa  94.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.207954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  41.98 
 
 		 641 aa  93.2  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  55.21 
 
 		 592 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  35.68 
 
 		 1147 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.71 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  52.87 
 
 		 580 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.35 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.41 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  58.1 
 
 		 1131 aa  85.1  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0546  hypothetical protein  34.48 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 		 467 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  47.96 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  36.69 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  43.92 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  50.52 
 
 		 1077 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 		 835 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 835 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.5 
 
 		 724 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  31.55 
 
 		 818 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  30.11 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  36.11 
 
 		 868 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2421  hypothetical protein  37.4 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 		 605 aa  57  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  36.36 
 
 		 674 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.31 
 
 		 721 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.45 
 
 		 771 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 		 835 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 		 836 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1672  hypothetical protein  29.91 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987329  normal  0.944723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>