72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7496 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  100 
 
 
691 aa  1400    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  79.85 
 
 
1243 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  70.04 
 
 
586 aa  340  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  35.45 
 
 
543 aa  227  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  35.09 
 
 
571 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  33.58 
 
 
453 aa  180  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  33.17 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  33.17 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  33.17 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  32.83 
 
 
453 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  31.64 
 
 
453 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  44.83 
 
 
788 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  59.26 
 
 
504 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  31.14 
 
 
417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  45.96 
 
 
884 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  43.89 
 
 
753 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  31.11 
 
 
463 aa  160  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  48.22 
 
 
918 aa  152  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  49.69 
 
 
710 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  70.75 
 
 
592 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  41.87 
 
 
663 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.17 
 
 
1152 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  27.86 
 
 
465 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.2 
 
 
1223 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  35.59 
 
 
802 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  53.12 
 
 
597 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.95 
 
 
651 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  56 
 
 
1147 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  64.29 
 
 
1131 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  56.07 
 
 
601 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  47.66 
 
 
596 aa  97.4  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
477 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  68.09 
 
 
580 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  35.48 
 
 
641 aa  94.4  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.73 
 
 
467 aa  88.6  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  50.88 
 
 
1077 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.71 
 
 
583 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  45.1 
 
 
727 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  27.09 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.61 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  33.45 
 
 
717 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  37.23 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.36 
 
 
605 aa  68.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  24.62 
 
 
372 aa  60.8  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2710  chitosanase  26.58 
 
 
171 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0388381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  28.79 
 
 
622 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
379 aa  57.4  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
721 aa  57.4  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.14 
 
 
724 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  26 
 
 
337 aa  55.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  42.02 
 
 
1199 aa  55.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.65 
 
 
835 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  29.33 
 
 
609 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  36.73 
 
 
868 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  36.21 
 
 
818 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.22 
 
 
771 aa  52.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 
511 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.34 
 
 
835 aa  52  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  32.61 
 
 
950 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  25.97 
 
 
347 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2916  hypothetical protein  41.35 
 
 
398 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
1140 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  23.95 
 
 
348 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  24.05 
 
 
2690 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.34 
 
 
835 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  28 
 
 
1748 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  38.75 
 
 
1124 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  22.62 
 
 
468 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
1140 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1672  hypothetical protein  30.39 
 
 
321 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987329  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.31 
 
 
2807 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  32.71 
 
 
674 aa  44.3  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>