71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1075 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  100 
 
 		 2690 aa  5244    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  43.44 
 
 		 1223 aa  321  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  37.53 
 
 		 1152 aa  242  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  39.46 
 
 		 465 aa  233  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  35.78 
 
 		 2042 aa  193  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  32.22 
 
 		 477 aa  143  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  33.25 
 
 		 460 aa  142  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  27.84 
 
 		 543 aa  107  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  27.21 
 
 		 1736 aa  100  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  28.54 
 
 		 571 aa  97.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  27.62 
 
 		 1748 aa  95.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  26.08 
 
 		 609 aa  89.4  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 511 aa  83.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  28.77 
 
 		 453 aa  81.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  29.91 
 
 		 453 aa  80.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  29.37 
 
 		 2886 aa  80.1  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  29.67 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  29.91 
 
 		 453 aa  79  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  29.91 
 
 		 453 aa  79  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  29.62 
 
 		 453 aa  78.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  27.01 
 
 		 463 aa  75.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  27.11 
 
 		 417 aa  74.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 912 aa  75.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  27.59 
 
 		 376 aa  72.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  42.52 
 
 		 767 aa  70.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  24.51 
 
 		 2239 aa  71.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 292 aa  70.5  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 1332 aa  68.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 1129 aa  68.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  30.26 
 
 		 2207 aa  67.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  25.62 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  25.81 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  31.58 
 
 		 1626 aa  65.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  29.34 
 
 		 915 aa  65.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  30.6 
 
 		 390 aa  65.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  24.81 
 
 		 691 aa  63.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 		 1140 aa  62.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.06 
 
 		 1212 aa  61.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 		 430 aa  61.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  28.19 
 
 		 477 aa  60.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  25.64 
 
 		 1895 aa  60.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  37.8 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 1140 aa  60.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1802 aa  60.1  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 1140 aa  59.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  25.78 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  40 
 
 		 1303 aa  57.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25.95 
 
 		 2807 aa  57.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  35.56 
 
 		 607 aa  58.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.33 
 
 		 1661 aa  56.6  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.62 
 
 		 1073 aa  56.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  29.13 
 
 		 897 aa  56.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 445 aa  55.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  31.21 
 
 		 2002 aa  54.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  32.43 
 
 		 332 aa  53.9  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1070 aa  53.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  27.24 
 
 		 332 aa  52.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  26.39 
 
 		 2772 aa  51.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0320  hypothetical protein  24.58 
 
 		 362 aa  51.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.481555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  30.93 
 
 		 614 aa  50.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  30.56 
 
 		 368 aa  49.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  33.79 
 
 		 332 aa  48.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1193 aa  48.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 408 aa  48.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  25.4 
 
 		 8918 aa  48.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 2082 aa  48.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1130  PKD domain containing protein  26.21 
 
 		 514 aa  47.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2924  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1033 aa  47.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0937262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 		 726 aa  47  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2710  chitosanase  31.06 
 
 		 171 aa  46.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0388381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  27.55 
 
 		 1302 aa  46.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>