62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01460 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  100 
 
 		 2239 aa  4448    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  27.64 
 
 		 1736 aa  113  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  32.77 
 
 		 2487 aa  96.3  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  32.46 
 
 		 3089 aa  89.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  30.84 
 
 		 2262 aa  85.9  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1802 aa  84.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1634 aa  81.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  30.4 
 
 		 772 aa  81.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  31.58 
 
 		 607 aa  80.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  29.66 
 
 		 897 aa  76.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.43 
 
 		 1073 aa  74.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  28.41 
 
 		 2344 aa  73.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  24.51 
 
 		 2690 aa  71.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1193 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 		 2831 aa  69.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  26.4 
 
 		 756 aa  68.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  32.62 
 
 		 2961 aa  68.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  26.17 
 
 		 1626 aa  67.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  25.25 
 
 		 1029 aa  63.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.47 
 
 		 1212 aa  61.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  26.13 
 
 		 1192 aa  61.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  31.61 
 
 		 2833 aa  59.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.69 
 
 		 616 aa  57.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1243 aa  57.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1083 aa  57.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  29.84 
 
 		 2588 aa  57.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1126 aa  56.2  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  39.36 
 
 		 2636 aa  55.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1902 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  31.37 
 
 		 608 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.6 
 
 		 1779 aa  54.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.98 
 
 		 2402 aa  54.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.65 
 
 		 1109 aa  53.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  34.73 
 
 		 4071 aa  53.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  39.77 
 
 		 501 aa  52.4  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  27.91 
 
 		 927 aa  51.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 1332 aa  51.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  29.28 
 
 		 683 aa  50.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1031 aa  50.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  25.91 
 
 		 2002 aa  50.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25 
 
 		 1002 aa  50.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  30.77 
 
 		 540 aa  49.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.72 
 
 		 720 aa  49.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  32.97 
 
 		 655 aa  48.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  29.73 
 
 		 2153 aa  49.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  28.57 
 
 		 1441 aa  48.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  25.34 
 
 		 1247 aa  48.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  40.51 
 
 		 1065 aa  47.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 		 2886 aa  47.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  32.32 
 
 		 1303 aa  47.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  25.86 
 
 		 483 aa  47  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.31 
 
 		 6885 aa  47.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12193  hypothetical protein  28.12 
 
 		 509 aa  47  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  26.14 
 
 		 1217 aa  46.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  28.57 
 
 		 554 aa  46.6  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  25.29 
 
 		 595 aa  46.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  32.26 
 
 		 874 aa  46.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  32.43 
 
 		 843 aa  45.8  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  31.34 
 
 		 2848 aa  45.8  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  31.93 
 
 		 461 aa  45.8  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1969 aa  45.8  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30 
 
 		 3544 aa  45.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>