52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3868 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 430 aa  896    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  76.02 
 
 		 432 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  37.44 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  38.72 
 
 		 1748 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  40.1 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  38.17 
 
 		 412 aa  243  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  37.82 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 912 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  43.92 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  37.01 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.43 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  25.3 
 
 		 465 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.41 
 
 		 1152 aa  83.2  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  25.29 
 
 		 1223 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  26.67 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  25.78 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  24.58 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  27.31 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  27.31 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  27.69 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  27.69 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  28.21 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  26.89 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  25.11 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  24.4 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  25.86 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  35.71 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  24.14 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  31.09 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 1129 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  24.46 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  24.64 
 
 		 384 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  23.15 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  24.07 
 
 		 2690 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  22.81 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  21.55 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 		 1140 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  23.92 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  22.87 
 
 		 1140 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  23.92 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  33.33 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  20.69 
 
 		 348 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  25.37 
 
 		 543 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  22.87 
 
 		 1140 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  23.23 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  23.7 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  29.25 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  23.41 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  26.59 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  18.97 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>