55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1409 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  100 
 
 		 432 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  76.02 
 
 		 430 aa  682    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  37.26 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  38.28 
 
 		 1748 aa  291  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  38.6 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 		 381 aa  247  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  35.94 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 912 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  41.63 
 
 		 292 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  34.14 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  24.47 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  29.07 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  23.96 
 
 		 477 aa  86.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.34 
 
 		 1152 aa  77.8  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  28.12 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.59 
 
 		 1223 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  28.38 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  31.09 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  27.11 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  36.21 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  25.62 
 
 		 2690 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  25.89 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  23.64 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  25.78 
 
 		 330 aa  57  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  24.79 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  23.55 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  25.31 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  23.55 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 1129 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  23.24 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  23.24 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  24.47 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  24.33 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  25.81 
 
 		 463 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  22.75 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  25 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 		 1140 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  25 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  22.58 
 
 		 511 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 1140 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  24.63 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 		 1140 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  29.13 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  23 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  20.56 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  25.22 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  23.99 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  26.01 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  24.26 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  27.2 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  19.93 
 
 		 609 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  24.89 
 
 		 612 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  31 
 
 		 571 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>