102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4861 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 376 aa  726    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  47.48 
 
 		 390 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  33.94 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  31.73 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 		 1140 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 		 1140 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 1140 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 1129 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  32.63 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  30 
 
 		 468 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  34.55 
 
 		 337 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  30.42 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  33.72 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  29.32 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  30.42 
 
 		 419 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  34.98 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  31.88 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  27.71 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  32.33 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  35.59 
 
 		 612 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  32.22 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  28.51 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  29.12 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  28.93 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  32.03 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  26.84 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  28.57 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  29.96 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  28.15 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  28.31 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  28.51 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  31.15 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  36.61 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  33.14 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  33.33 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  24.44 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  29.05 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  25 
 
 		 1223 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  25.85 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  32.75 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  32.75 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  32.75 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  32.75 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  24 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  32.54 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  32.54 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  32.54 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  32.54 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  26.02 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  32.54 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  32.54 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  33.5 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  33.5 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  33.5 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  32.54 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  34.15 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  30.92 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  33.5 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  32.31 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  40.31 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  33 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  31.54 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.78 
 
 		 1152 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  33.66 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  28.76 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  30.09 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  30.09 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 		 477 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  38.4 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  31.54 
 
 		 360 aa  57  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  38.4 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  38.4 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  38.4 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  38.4 
 
 		 506 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  38.4 
 
 		 506 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  27.6 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  27.63 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  32.69 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  26.55 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  31.01 
 
 		 609 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 912 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  30.85 
 
 		 1748 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  28.71 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  27.5 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  29.66 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  29.24 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1959  hypothetical protein  27.92 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.987661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  40.96 
 
 		 379 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  25.49 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2247  glycosy hydrolase family protein  29.81 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  23.57 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  23.57 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  23.57 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  23.57 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  23.57 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  23.57 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>