81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1259 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  88.02 
 
 		 409 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  100 
 
 		 406 aa  789    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  93.48 
 
 		 414 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  88.02 
 
 		 409 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  97.44 
 
 		 406 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  88.26 
 
 		 409 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  87.53 
 
 		 409 aa  680    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  75.75 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  75.75 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  76.02 
 
 		 520 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  76.09 
 
 		 493 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  75.75 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  77.84 
 
 		 506 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  77.84 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  60.16 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  58.77 
 
 		 387 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  49.86 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  49.59 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  49.59 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  49.59 
 
 		 368 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  48.9 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  48.9 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  48.9 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  48.63 
 
 		 369 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  48.63 
 
 		 369 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  49.58 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  48.26 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  48.44 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  49.87 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  47.67 
 
 		 371 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  47.04 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  47.04 
 
 		 371 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  46.67 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  46.19 
 
 		 393 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  46.92 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  43.15 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  48.06 
 
 		 371 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  47.74 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  47.31 
 
 		 367 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  35.11 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  40.4 
 
 		 376 aa  209  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  31.27 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  35.34 
 
 		 344 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  38.06 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  31.17 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  31.96 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  31.5 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  33.71 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  37.3 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  34.77 
 
 		 612 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  30.69 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  26.65 
 
 		 332 aa  87  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  32.47 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  27.46 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  38.21 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  33.07 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  30.88 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  32.73 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  32 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  32 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  32.11 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  35.92 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  31.6 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  35.89 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  28.98 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 1129 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 1140 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 1140 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 1140 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  26.13 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  24.29 
 
 		 465 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  25.99 
 
 		 1152 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  27.44 
 
 		 609 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>