20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1959 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2247  glycosy hydrolase family protein  97.57 
 
 		 371 aa  691    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  744    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.987661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2167  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5342  hypothetical protein  26.27 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5617  hypothetical protein  26.93 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000140719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5013  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5393  hypothetical protein  26.01 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5070  hypothetical protein  26.65 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4902  hypothetical protein  26.89 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5455  hypothetical protein  26.65 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5311  hypothetical protein  25.74 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.38043e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4915  hypothetical protein  25.74 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5336  hypothetical protein  26.67 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3758  hypothetical protein  26.46 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.7 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  25.42 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  26.32 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  23.32 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>