30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2167 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2167  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 380 aa  775    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2247  glycosy hydrolase family protein  32.28 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1959  hypothetical protein  31.99 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.987661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5617  hypothetical protein  27.18 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000140719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5342  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5393  hypothetical protein  27.65 
 
 		 361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5311  hypothetical protein  27.65 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.38043e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4902  hypothetical protein  27.65 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5455  hypothetical protein  27.65 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5070  hypothetical protein  27.65 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4915  hypothetical protein  27.65 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5336  hypothetical protein  27.06 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5013  hypothetical protein  25.83 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3758  hypothetical protein  25.83 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  24.66 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  32.35 
 
 		 493 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  31 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  26.95 
 
 		 468 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  30.48 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  30.48 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  31.37 
 
 		 514 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  31.37 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  31.37 
 
 		 520 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  31.07 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  31.37 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  22.98 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  29.52 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  24.14 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  29.52 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  29.52 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>