229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0269 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 477 aa  987    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  53.9 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  38.8 
 
 		 1152 aa  259  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  38.48 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 		 511 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  33.17 
 
 		 609 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  33.41 
 
 		 1223 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  30.17 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  30.45 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  26.48 
 
 		 543 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  30.38 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  30.38 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  30.38 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  30.11 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  29.76 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  30.65 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  29.55 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  31.98 
 
 		 2690 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  27.32 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  56.32 
 
 		 563 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  26.77 
 
 		 1748 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  30.08 
 
 		 376 aa  96.7  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  26.29 
 
 		 691 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 1129 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  53.41 
 
 		 591 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  67.16 
 
 		 611 aa  94  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  51.96 
 
 		 922 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 381 aa  90.1  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  56.41 
 
 		 895 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  53.93 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  28.1 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 		 334 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  52.33 
 
 		 554 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 1140 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  24.47 
 
 		 376 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 1140 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  51.25 
 
 		 600 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  62.32 
 
 		 649 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  23.96 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  56.34 
 
 		 741 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  60 
 
 		 1224 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 1140 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.72 
 
 		 842 aa  84  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  50.63 
 
 		 707 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  43.27 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  59.09 
 
 		 730 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 912 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  30.58 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  57.35 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 		 739 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  56.92 
 
 		 1601 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  27.39 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  52.24 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  51.35 
 
 		 1077 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 619 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  60 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  58.46 
 
 		 928 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  58.46 
 
 		 742 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  48.91 
 
 		 526 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  50.62 
 
 		 900 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  55.13 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  54.55 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.81 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 773 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  55.88 
 
 		 630 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 639 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.16 
 
 		 831 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  47.56 
 
 		 710 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  27.03 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  57.14 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 		 814 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  26.5 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  50.77 
 
 		 789 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.95 
 
 		 1051 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  25.69 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  56.45 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  42.67 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  50.77 
 
 		 948 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  43.66 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  53.12 
 
 		 982 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  25.88 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  29.17 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  26.21 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.21 
 
 		 710 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.37 
 
 		 790 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  42.68 
 
 		 599 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.27 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.61 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  42.17 
 
 		 558 aa  67  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 683 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  58.62 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  50.79 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  46.77 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>