106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00789 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  100 
 
 
366 aa  756    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  42.25 
 
 
337 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  37.78 
 
 
330 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  36.16 
 
 
332 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  37.54 
 
 
332 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  35.78 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  34.52 
 
 
468 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  35.31 
 
 
419 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  35.31 
 
 
429 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  38.58 
 
 
393 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  40.45 
 
 
367 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  35.65 
 
 
348 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  34.28 
 
 
421 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  32.35 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  34.73 
 
 
384 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  38.52 
 
 
344 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  34.53 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  31.2 
 
 
362 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  30 
 
 
356 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  30.09 
 
 
356 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  30.16 
 
 
612 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  31.02 
 
 
376 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  31.47 
 
 
368 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  29.82 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 
369 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  31.03 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  31.03 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  31.03 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  31.03 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  31.03 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  29.6 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  29.6 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  29.71 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  31.03 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  29.24 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  32.3 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  30.6 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  33.05 
 
 
403 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  30.83 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  28.96 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  32.47 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  29.45 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  34.02 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  31.56 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  33.33 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  30.69 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  32.86 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  29.39 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  28.51 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  28.39 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  29.5 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  32.65 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  27.32 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  29.33 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  29.13 
 
 
437 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  28.89 
 
 
514 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  28.89 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  29.84 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  28.98 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  29.53 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
1140 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  28.31 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  28.31 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  28.68 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  29.53 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  30.65 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
1140 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  28.57 
 
 
506 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  28.57 
 
 
520 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  28.62 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  28.57 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  37.93 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  27.98 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
1129 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
1140 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  27.31 
 
 
1748 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  36.21 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  23.88 
 
 
417 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  39.78 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  37.37 
 
 
912 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  31.58 
 
 
1152 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  26.97 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  28.86 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  23.68 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  24.62 
 
 
465 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  29.69 
 
 
460 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  26.72 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  32.99 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  30.7 
 
 
2807 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
477 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  39.51 
 
 
511 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  29.34 
 
 
453 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  29.34 
 
 
453 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  28.93 
 
 
453 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.12 
 
 
1223 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  36.17 
 
 
609 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  28.51 
 
 
453 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>