95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0105 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0105  cellulase  100 
 
 		 393 aa  775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  72.78 
 
 		 385 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  61.42 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  61.13 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  61.72 
 
 		 421 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  62.12 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  54.47 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  63.06 
 
 		 367 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  43.94 
 
 		 347 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  43.41 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  42.51 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  37.35 
 
 		 337 aa  199  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  40.75 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  37.14 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  36.5 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  37.66 
 
 		 330 aa  190  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  36.77 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  37 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  38.15 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  38.18 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  38.18 
 
 		 612 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  31.93 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  31.23 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  34.51 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  36.32 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  30.99 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  33.47 
 
 		 370 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  33.47 
 
 		 368 aa  106  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  33.47 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  33.47 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  33.47 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  33.47 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  33.47 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  35.44 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  35.44 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  35.44 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  35.44 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  35.44 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  33.47 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 		 1140 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  36.88 
 
 		 1140 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  36.32 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  29.08 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 		 1129 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  37.77 
 
 		 1140 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  35.32 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  35.32 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  33.6 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  33.2 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  28.41 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  28.41 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  31.8 
 
 		 360 aa  94  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  39.88 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  32.94 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  29.44 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  33.62 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  30.99 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  34.75 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  33.33 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  33.05 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  33.05 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  33.14 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  33.62 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  33.33 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  32.86 
 
 		 406 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  32.64 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  32.64 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  32.34 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  32.16 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  32.34 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  32.34 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  30.35 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  32.91 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  24.81 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  31.33 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  24.67 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.03 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  22.32 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  25.2 
 
 		 1152 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  24.47 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  32.61 
 
 		 1748 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 		 912 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  36.27 
 
 		 1223 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 		 477 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  28.3 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  36.78 
 
 		 543 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  23.21 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  23.21 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  36.9 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  32 
 
 		 453 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>