79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2637 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  100 
 
 
370 aa  741    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  91.35 
 
 
371 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  99.73 
 
 
367 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  52.72 
 
 
370 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  53.56 
 
 
371 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  53.11 
 
 
371 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  51.49 
 
 
369 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  51.76 
 
 
369 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  51.49 
 
 
369 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  51.49 
 
 
369 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  51.49 
 
 
369 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  52.45 
 
 
360 aa  358  8e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  47.57 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  47.57 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  47.3 
 
 
368 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  47.3 
 
 
368 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  47.57 
 
 
368 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  47.68 
 
 
365 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  47.68 
 
 
365 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  52.34 
 
 
371 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  51.73 
 
 
371 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  47.03 
 
 
368 aa  352  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  47.44 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  46.26 
 
 
392 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  46.81 
 
 
393 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  46.11 
 
 
393 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  44.5 
 
 
410 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  50.14 
 
 
520 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  47.37 
 
 
406 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  46.76 
 
 
409 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  46.76 
 
 
409 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 
514 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  47.74 
 
 
406 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 
437 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  49.86 
 
 
508 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  47.41 
 
 
409 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  50.57 
 
 
506 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  50.57 
 
 
506 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  48.41 
 
 
414 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  48.48 
 
 
379 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  46.26 
 
 
409 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  49.43 
 
 
493 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  42.08 
 
 
403 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  39.67 
 
 
388 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  38.98 
 
 
376 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  30.23 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  32.11 
 
 
385 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  34.96 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  35.32 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  31.98 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  29.08 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  30.42 
 
 
384 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  31.14 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  30.89 
 
 
468 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  33.2 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  29.09 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  29.09 
 
 
429 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  35.66 
 
 
612 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  34.98 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  28.36 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  33.33 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  31.5 
 
 
398 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  30.95 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  29.23 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  33.71 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  29.27 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  29.03 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  29.53 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  34.21 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
1140 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
1129 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
1140 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
1140 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  25.38 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  23.81 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  36.25 
 
 
445 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.02 
 
 
460 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>