46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1561 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
379 aa  798    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  46.88 
 
 
372 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  26.67 
 
 
571 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  27.32 
 
 
417 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  27.95 
 
 
453 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  27.95 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  27.95 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  24.74 
 
 
543 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  27.67 
 
 
453 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  27.17 
 
 
453 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  27.17 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  25.94 
 
 
463 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  23.67 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  25.76 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  25.96 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  27.73 
 
 
691 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  24.34 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  25.91 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  28.06 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  22.79 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  24.03 
 
 
468 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  27.49 
 
 
390 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  24.12 
 
 
356 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  28.47 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  29.19 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  26.62 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  26.62 
 
 
421 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  25.09 
 
 
460 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  30.23 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  25.92 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  26.62 
 
 
429 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  24.91 
 
 
344 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  24.92 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  24.48 
 
 
362 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  28.04 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  27.92 
 
 
1223 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  23.08 
 
 
1152 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  23.86 
 
 
612 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  27.44 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  23.31 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  25.74 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  25.9 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  25.9 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  25.9 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>