96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1206 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  100 
 
 		 347 aa  705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  86.49 
 
 		 348 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  58.13 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  44.95 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  42.68 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  43.52 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  42.68 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  40.39 
 
 		 468 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  42.68 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  44.95 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  44.01 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  36.39 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  34.24 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  33.85 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  37.4 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  35.21 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  34.53 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  35.17 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  34.56 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  34.95 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  34.95 
 
 		 612 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1129 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  29.19 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  31.2 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  32.08 
 
 		 406 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  31.2 
 
 		 414 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  31.5 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  29.86 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  29.86 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  30.5 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  29.86 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  26.25 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  29.79 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  29.62 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  30.98 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  30.48 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  29.11 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  30.82 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  29.11 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  28.92 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  27.25 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  29.84 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  28.05 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  28.05 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  29.85 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  28.77 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  27.48 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  27.48 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  27.48 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  27.48 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  27.48 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  28.77 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  33.7 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  28.05 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  33.7 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  28.42 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 1140 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  29.03 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 1140 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  29.03 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 1140 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  28.53 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  28.78 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  24.44 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  31.91 
 
 		 520 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  31.91 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  31.91 
 
 		 506 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  27.8 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  32.77 
 
 		 514 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  31.91 
 
 		 508 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  31.91 
 
 		 437 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  31.58 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 477 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  26.67 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  25.39 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.26 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  33.03 
 
 		 543 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  25.97 
 
 		 691 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  24.2 
 
 		 1748 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 912 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  27.88 
 
 		 477 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  23.5 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  24.06 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  24.06 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  18.97 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  24.06 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  24.8 
 
 		 1152 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  24.26 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  28.04 
 
 		 377 aa  42.7  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 292 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 511 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  22.96 
 
 		 453 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  22.93 
 
 		 453 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>