262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1240 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  100 
 
 		 1748 aa  3520    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  68.9 
 
 		 1160 aa  1152    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  61.76 
 
 		 1275 aa  563  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  49.29 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  47.81 
 
 		 1247 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  42.89 
 
 		 412 aa  345  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  32.49 
 
 		 1223 aa  332  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  42.47 
 
 		 445 aa  309  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  47.71 
 
 		 1002 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  42.49 
 
 		 381 aa  303  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  38.28 
 
 		 432 aa  293  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  41.16 
 
 		 912 aa  292  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  41.4 
 
 		 1474 aa  290  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  47.22 
 
 		 1295 aa  288  7e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  43.3 
 
 		 1217 aa  287  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  38.72 
 
 		 430 aa  286  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  43.53 
 
 		 1585 aa  286  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  36.46 
 
 		 376 aa  266  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  49.36 
 
 		 1108 aa  258  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  44.79 
 
 		 292 aa  236  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  45.36 
 
 		 991 aa  234  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39 
 
 		 3793 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  38.94 
 
 		 2278 aa  215  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  41.87 
 
 		 1266 aa  209  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  53.61 
 
 		 1414 aa  205  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  35.58 
 
 		 377 aa  203  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  41.63 
 
 		 1303 aa  197  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  40.08 
 
 		 1386 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  33.5 
 
 		 1288 aa  184  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.63 
 
 		 1657 aa  167  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1228 aa  148  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  33.39 
 
 		 2270 aa  145  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1329 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 434 aa  139  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.99 
 
 		 1068 aa  131  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  40.86 
 
 		 1302 aa  119  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  34.9 
 
 		 1059 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  34.9 
 
 		 1059 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.82 
 
 		 460 aa  115  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.84 
 
 		 4429 aa  109  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  32.29 
 
 		 1020 aa  109  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  28.18 
 
 		 989 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  36.17 
 
 		 1418 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.57 
 
 		 2713 aa  106  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  32 
 
 		 1152 aa  105  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  36.17 
 
 		 1050 aa  101  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  32.35 
 
 		 691 aa  98.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  29.74 
 
 		 2005 aa  97.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.55 
 
 		 5453 aa  95.9  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 477 aa  95.5  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.48 
 
 		 1495 aa  94.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  31.55 
 
 		 1018 aa  93.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.87 
 
 		 1041 aa  93.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  30.6 
 
 		 215 aa  92.8  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.03 
 
 		 2690 aa  90.5  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.67 
 
 		 2286 aa  90.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  25.82 
 
 		 465 aa  89  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1547 aa  88.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  30.02 
 
 		 3737 aa  82  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  38.68 
 
 		 106 aa  80.1  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.07 
 
 		 984 aa  78.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  31.79 
 
 		 1780 aa  77.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  31.57 
 
 		 994 aa  77.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  28.83 
 
 		 3324 aa  75.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  37.24 
 
 		 691 aa  75.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  30.95 
 
 		 1215 aa  75.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  32.43 
 
 		 1141 aa  74.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0677  chitooligosaccharide deacetylase-like  25.56 
 
 		 267 aa  71.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457424  unclonable  0.0000000136805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  27.92 
 
 		 1037 aa  71.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.47 
 
 		 1679 aa  70.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.62 
 
 		 1343 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  30.58 
 
 		 1019 aa  67.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  24.68 
 
 		 822 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  25.33 
 
 		 332 aa  67.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1406 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1980 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  29.31 
 
 		 6497 aa  67.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  44.93 
 
 		 815 aa  66.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  39.33 
 
 		 1362 aa  66.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  27.31 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28.88 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.2 
 
 		 1222 aa  66.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.16 
 
 		 1483 aa  65.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  25.88 
 
 		 332 aa  65.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1098  polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 380 aa  65.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1243 aa  65.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3116  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 267 aa  64.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0569329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  37.93 
 
 		 244 aa  63.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  28.27 
 
 		 1331 aa  63.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  39.56 
 
 		 778 aa  63.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 271 aa  63.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  26.78 
 
 		 330 aa  63.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.02 
 
 		 3542 aa  63.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  28.71 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.8 
 
 		 1146 aa  62.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  26.02 
 
 		 1377 aa  62.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 594 aa  62  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.67 
 
 		 703 aa  61.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3388  hypothetical protein  37.08 
 
 		 245 aa  62  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1313 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>