72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0231 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  100 
 
 
429 aa  839    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
1140 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
1140 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
1140 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
1129 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  27.69 
 
 
398 aa  100  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  28.75 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  32.55 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  26.42 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  29.08 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.41 
 
 
1152 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  27.36 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  30.3 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  24.71 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  28.86 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  26.32 
 
 
332 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  29.63 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  31.22 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  27.35 
 
 
465 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  31.41 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  31.41 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  25.99 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  32.46 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  30.37 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  30.73 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  30.37 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  29.84 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  27.32 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  25.48 
 
 
417 aa  60.1  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  30.2 
 
 
393 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  26.97 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  25.71 
 
 
347 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  26.78 
 
 
393 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  24.51 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
912 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  24.51 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  24.51 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  24.51 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  24.51 
 
 
369 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  30.09 
 
 
379 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  26.6 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  26.11 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  23.4 
 
 
477 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  25.48 
 
 
1223 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  24.77 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  24.77 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  28.12 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  24.5 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  25.38 
 
 
367 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 
408 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  28.47 
 
 
612 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  27.1 
 
 
387 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  26.13 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  23.76 
 
 
609 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  25.38 
 
 
370 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  27.68 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  27.68 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  27.68 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  21.32 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  21.28 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  23.63 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  23.63 
 
 
368 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  27.75 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  23.63 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  23.63 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  23.63 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.634821 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  23.63 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  23.63 
 
 
370 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  25.91 
 
 
388 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  23.63 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>