48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3714 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  100 
 
 
417 aa  867    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  39.79 
 
 
571 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  40.31 
 
 
463 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  38.78 
 
 
453 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  38.78 
 
 
453 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  38.78 
 
 
453 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  38.52 
 
 
453 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  38.52 
 
 
453 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  38.52 
 
 
453 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  35.23 
 
 
543 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  31.12 
 
 
691 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 
477 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.49 
 
 
1152 aa  136  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  28.29 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  30.61 
 
 
460 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2710  chitosanase  37.72 
 
 
171 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0388381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  32.69 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
379 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  26.61 
 
 
1223 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  25 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  26.85 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  27.59 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 
511 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
1140 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
1140 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
1140 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  23.6 
 
 
366 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  25.48 
 
 
429 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  26.62 
 
 
609 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 
912 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  27.11 
 
 
2690 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  26.36 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  24.86 
 
 
477 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  23.99 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  25.13 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.48 
 
 
2772 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  23.41 
 
 
430 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  33.33 
 
 
332 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  36.26 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  31.37 
 
 
332 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  24.26 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  31.15 
 
 
2807 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  35.16 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  35.16 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  35.16 
 
 
365 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  35.16 
 
 
365 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  35.16 
 
 
370 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  35.16 
 
 
370 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.634821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>