170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3440 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1259 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  100 
 
 		 2772 aa  5660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  36.85 
 
 		 2367 aa  347  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  37.31 
 
 		 2807 aa  348  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  37.18 
 
 		 2411 aa  348  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  36.82 
 
 		 2421 aa  341  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  36.94 
 
 		 2454 aa  340  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1059 aa  300  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  38.59 
 
 		 750 aa  245  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1976 aa  181  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  29.03 
 
 		 953 aa  160  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.56 
 
 		 4978 aa  137  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  31.7 
 
 		 627 aa  132  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  31.04 
 
 		 2418 aa  127  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  26.83 
 
 		 976 aa  127  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  35.64 
 
 		 1371 aa  121  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  33.5 
 
 		 1389 aa  114  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  24.17 
 
 		 3793 aa  104  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  35.33 
 
 		 799 aa  101  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  32.11 
 
 		 707 aa  101  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  35.06 
 
 		 792 aa  99.8  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  34.46 
 
 		 2064 aa  97.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  25.09 
 
 		 815 aa  95.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.28 
 
 		 2296 aa  90.1  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  33.72 
 
 		 1162 aa  89.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.07 
 
 		 2927 aa  89.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  32.5 
 
 		 822 aa  87  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42.11 
 
 		 4896 aa  86.7  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1547 aa  86.3  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  31.65 
 
 		 636 aa  85.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.68 
 
 		 637 aa  84.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  30.48 
 
 		 1526 aa  82  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  39.8 
 
 		 3227 aa  81.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.68 
 
 		 794 aa  82  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  39.58 
 
 		 3471 aa  79.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1066 aa  79  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  43.21 
 
 		 3602 aa  78.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.86 
 
 		 2005 aa  77.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  32.98 
 
 		 1483 aa  76.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1488 aa  75.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.91 
 
 		 2377 aa  74.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  29.66 
 
 		 886 aa  74.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  41.76 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.41 
 
 		 890 aa  73.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.84 
 
 		 808 aa  71.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.65 
 
 		 3927 aa  70.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1287 aa  70.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  42.55 
 
 		 5745 aa  70.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.5 
 
 		 1602 aa  69.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  33.64 
 
 		 599 aa  69.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 		 1606 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.68 
 
 		 3737 aa  68.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.35 
 
 		 1620 aa  68.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  49.28 
 
 		 1139 aa  68.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 885 aa  67.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  33.63 
 
 		 561 aa  67.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  24.16 
 
 		 1527 aa  66.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  34 
 
 		 2022 aa  65.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.44 
 
 		 2713 aa  65.9  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1313 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1064 aa  64.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  37.98 
 
 		 2267 aa  63.9  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  37.5 
 
 		 429 aa  63.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  27.68 
 
 		 1345 aa  62.8  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  32.61 
 
 		 1461 aa  62.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  27.81 
 
 		 642 aa  62  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.97 
 
 		 1987 aa  62  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1193 aa  61.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  42.27 
 
 		 2416 aa  61.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1969 aa  61.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  28.38 
 
 		 1140 aa  61.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.97 
 
 		 1466 aa  60.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  35.65 
 
 		 2478 aa  60.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.62 
 
 		 3191 aa  60.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  35.63 
 
 		 852 aa  60.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  25.93 
 
 		 1152 aa  60.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  36.56 
 
 		 2588 aa  60.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  37.04 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  33.72 
 
 		 871 aa  59.3  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  37.5 
 
 		 3958 aa  59.7  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  32.71 
 
 		 2270 aa  59.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  38.24 
 
 		 657 aa  58.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  38.24 
 
 		 648 aa  58.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  22.88 
 
 		 1079 aa  58.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 694 aa  58.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  33.02 
 
 		 2402 aa  58.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.33 
 
 		 6497 aa  58.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  23.46 
 
 		 938 aa  58.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.2 
 
 		 662 aa  58.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1665 aa  57.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  34.88 
 
 		 3324 aa  57.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  33.62 
 
 		 1152 aa  57.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  22.67 
 
 		 496 aa  57.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  33.08 
 
 		 676 aa  56.6  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  33 
 
 		 2487 aa  56.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  26.77 
 
 		 465 aa  56.2  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.67 
 
 		 4071 aa  55.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  35.42 
 
 		 2602 aa  55.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1245 aa  55.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  37.89 
 
 		 751 aa  55.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>