More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1739 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  59.03 
 
 		 1389 aa  1642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1371 aa  2800    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  48.59 
 
 		 2972 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  42.88 
 
 		 2980 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  26.17 
 
 		 1162 aa  270  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  30.32 
 
 		 650 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.27 
 
 		 1602 aa  181  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  32.9 
 
 		 815 aa  175  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.45 
 
 		 1620 aa  169  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.86 
 
 		 1466 aa  166  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.17 
 
 		 1606 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.86 
 
 		 1094 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.24 
 
 		 2272 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.5 
 
 		 752 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.81 
 
 		 1361 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.49 
 
 		 1667 aa  153  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1667 aa  152  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  26.86 
 
 		 2176 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1682 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  27.47 
 
 		 963 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  33.04 
 
 		 642 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.16 
 
 		 627 aa  147  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  27.09 
 
 		 1814 aa  145  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  30.06 
 
 		 561 aa  145  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28.34 
 
 		 799 aa  145  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  28.12 
 
 		 1862 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  26.6 
 
 		 2807 aa  142  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.6 
 
 		 2454 aa  142  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.6 
 
 		 2411 aa  142  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.6 
 
 		 2367 aa  141  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  29.46 
 
 		 822 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.6 
 
 		 2421 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  30.46 
 
 		 978 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.97 
 
 		 1842 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  29.41 
 
 		 1236 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  36.3 
 
 		 1300 aa  128  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  36.51 
 
 		 859 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1059 aa  126  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  37.3 
 
 		 1882 aa  126  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  37.6 
 
 		 675 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.08 
 
 		 1987 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  31.28 
 
 		 2000 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  29.81 
 
 		 2036 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  29.56 
 
 		 735 aa  122  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  30 
 
 		 575 aa  122  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  35.15 
 
 		 2772 aa  121  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.99 
 
 		 637 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.52 
 
 		 3295 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.86 
 
 		 581 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  27.41 
 
 		 941 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30.94 
 
 		 2554 aa  119  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  35.71 
 
 		 792 aa  119  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  27.56 
 
 		 1783 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.63 
 
 		 1969 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  37.78 
 
 		 551 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.08 
 
 		 547 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  29.42 
 
 		 1387 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.73 
 
 		 823 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.19 
 
 		 2122 aa  116  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  25.93 
 
 		 1230 aa  116  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  31.52 
 
 		 1356 aa  115  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1259 aa  115  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  34.82 
 
 		 840 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.44 
 
 		 669 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  34.16 
 
 		 750 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 734 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  34.08 
 
 		 1120 aa  112  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  33.57 
 
 		 679 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  34.31 
 
 		 1241 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  36.49 
 
 		 658 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  36.61 
 
 		 791 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  25.37 
 
 		 1528 aa  110  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.26 
 
 		 713 aa  108  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.54 
 
 		 685 aa  108  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  34.58 
 
 		 1732 aa  108  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.93 
 
 		 615 aa  108  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.45 
 
 		 802 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  30.47 
 
 		 821 aa  107  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  33.5 
 
 		 794 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1064 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  39.52 
 
 		 3227 aa  106  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  33.47 
 
 		 719 aa  106  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  29.37 
 
 		 530 aa  106  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  31.88 
 
 		 861 aa  105  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1488 aa  105  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 870 aa  105  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1287 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  25.83 
 
 		 1011 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35 
 
 		 930 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  31.01 
 
 		 958 aa  103  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  28.03 
 
 		 636 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.43 
 
 		 786 aa  102  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  28.87 
 
 		 1292 aa  102  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  51.22 
 
 		 1139 aa  102  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  28.64 
 
 		 528 aa  102  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1282 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  34.28 
 
 		 910 aa  100  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 662 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  31.36 
 
 		 2064 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  25.41 
 
 		 952 aa  100  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>