235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6939 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  100 
 
 		 886 aa  1805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  31.4 
 
 		 642 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1287 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  38.15 
 
 		 662 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.35 
 
 		 1606 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  37.72 
 
 		 650 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  24.62 
 
 		 1620 aa  141  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.38 
 
 		 1466 aa  132  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  31.16 
 
 		 4071 aa  128  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.78 
 
 		 627 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  26.47 
 
 		 808 aa  124  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.08 
 
 		 1602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  22.39 
 
 		 1162 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.45 
 
 		 885 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1488 aa  121  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  29.21 
 
 		 2833 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  23.71 
 
 		 822 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.84 
 
 		 794 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.36 
 
 		 938 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  25.59 
 
 		 652 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  23.95 
 
 		 636 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  24.01 
 
 		 799 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.9 
 
 		 792 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  26.91 
 
 		 541 aa  98.2  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  24.21 
 
 		 1371 aa  97.8  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  43.3 
 
 		 1163 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  28.68 
 
 		 750 aa  97.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  24.6 
 
 		 890 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  26.94 
 
 		 749 aa  95.5  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  27.63 
 
 		 751 aa  94.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.57 
 
 		 5453 aa  94.7  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1313 aa  92.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  28.43 
 
 		 1222 aa  90.9  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  27.02 
 
 		 735 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  36 
 
 		 1228 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1245 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  34.9 
 
 		 677 aa  84.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  26.92 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  31.23 
 
 		 1152 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  26.6 
 
 		 1140 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  30.08 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  28 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  25.24 
 
 		 3542 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 1230 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  31.06 
 
 		 2367 aa  77.8  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  31.06 
 
 		 2411 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  27.18 
 
 		 535 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  31.39 
 
 		 658 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  30.43 
 
 		 2421 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  33.03 
 
 		 2980 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  30.43 
 
 		 2454 aa  76.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  30.43 
 
 		 2807 aa  75.5  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1259 aa  74.7  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  29.66 
 
 		 2772 aa  74.3  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  24.76 
 
 		 637 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30 
 
 		 3227 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  30.47 
 
 		 1987 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.86 
 
 		 774 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  25.51 
 
 		 2972 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  39.33 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  34.78 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  31.25 
 
 		 967 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  29.08 
 
 		 1389 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  36.36 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  34.43 
 
 		 3682 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.41 
 
 		 3793 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  35.16 
 
 		 2064 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  29.46 
 
 		 815 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  34.09 
 
 		 797 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  38.04 
 
 		 4429 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1059 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  32.77 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  33.53 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  22.75 
 
 		 3851 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  36.36 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  34.13 
 
 		 1862 aa  65.1  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.33 
 
 		 2296 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1064 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  26.01 
 
 		 1463 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  37.08 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.56 
 
 		 1882 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1682 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.52 
 
 		 2270 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.85 
 
 		 978 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1111 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  35.56 
 
 		 1842 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  32.43 
 
 		 6497 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  34.84 
 
 		 1300 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  31.71 
 
 		 963 aa  62  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  34.51 
 
 		 2000 aa  61.6  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  40.59 
 
 		 676 aa  61.2  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  32.63 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.54 
 
 		 1094 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  43.28 
 
 		 3324 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  29.27 
 
 		 1120 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.71 
 
 		 2927 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  31.09 
 
 		 910 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  32.1 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  36.73 
 
 		 845 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  33.8 
 
 		 2122 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>