109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3752 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1014    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  38.24 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  32 
 
 		 541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  33.46 
 
 		 4071 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1245 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  28.23 
 
 		 938 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2833 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1313 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  29 
 
 		 1222 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1287 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  30.62 
 
 		 650 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.69 
 
 		 1620 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  29.48 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  29.48 
 
 		 648 aa  83.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  33.61 
 
 		 797 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  30.36 
 
 		 532 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  28.85 
 
 		 535 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  29.84 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  34.23 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  35.85 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  28.74 
 
 		 636 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.63 
 
 		 890 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  30.08 
 
 		 886 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  34.78 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.46 
 
 		 1602 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  29.53 
 
 		 1140 aa  76.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1488 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  27.01 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  36.8 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.55 
 
 		 799 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  25.43 
 
 		 2980 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  37.62 
 
 		 885 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  35.11 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  28.45 
 
 		 2972 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  25.66 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  36.84 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  25.95 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  36.99 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  31.97 
 
 		 968 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  26.27 
 
 		 766 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  31.97 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  37.5 
 
 		 1230 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  31.43 
 
 		 1266 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  34.07 
 
 		 3682 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  31.91 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.69 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  30.77 
 
 		 967 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  28.34 
 
 		 1371 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.88 
 
 		 1389 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1064 aa  60.1  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  33.86 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  30.43 
 
 		 742 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  32.35 
 
 		 694 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1228 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.2 
 
 		 1466 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  34.19 
 
 		 1345 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.91 
 
 		 991 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  32.32 
 
 		 2270 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  32.67 
 
 		 963 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  32.67 
 
 		 969 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  34.74 
 
 		 4429 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  38.16 
 
 		 1163 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  46.43 
 
 		 3324 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  38.03 
 
 		 792 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  30.07 
 
 		 3851 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  27.88 
 
 		 677 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.6 
 
 		 822 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  47.27 
 
 		 3793 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  27.62 
 
 		 1162 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  28.48 
 
 		 989 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  29.33 
 
 		 1288 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.08 
 
 		 1606 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  36.78 
 
 		 751 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  40 
 
 		 711 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.59 
 
 		 2807 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.17 
 
 		 794 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  26.57 
 
 		 2454 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  32.99 
 
 		 1463 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  31.91 
 
 		 637 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  25.42 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  32.26 
 
 		 676 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1111 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.9 
 
 		 3542 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  26.57 
 
 		 2421 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  25 
 
 		 689 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2367 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  25.58 
 
 		 774 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2411 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  41.07 
 
 		 5745 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.39 
 
 		 1068 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1259 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  30.99 
 
 		 978 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 1152 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1980 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  23.21 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  29.46 
 
 		 871 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 		 599 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  34.65 
 
 		 2402 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  30 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  26.47 
 
 		 815 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>