129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3220 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 1980 aa  3844    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.17 
 
 		 2270 aa  350  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  38.42 
 
 		 1243 aa  246  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1067 aa  161  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.52 
 
 		 3793 aa  106  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.24 
 
 		 2411 aa  106  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.31 
 
 		 2367 aa  105  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.34 
 
 		 1800 aa  105  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1315 aa  103  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  34.49 
 
 		 1247 aa  102  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.24 
 
 		 717 aa  103  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.47 
 
 		 711 aa  102  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  38.14 
 
 		 2402 aa  101  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  26.04 
 
 		 1987 aa  98.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1969 aa  92  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25.28 
 
 		 2807 aa  83.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  25.72 
 
 		 2454 aa  83.2  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  43.27 
 
 		 1483 aa  82.4  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  25.83 
 
 		 2421 aa  82  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.77 
 
 		 1657 aa  81.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  42.71 
 
 		 648 aa  79.7  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  42.71 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  29.95 
 
 		 1716 aa  77.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1439 aa  75.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  23.96 
 
 		 1389 aa  75.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.04 
 
 		 3927 aa  74.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1111 aa  73.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  33.61 
 
 		 599 aa  73.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1313 aa  73.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1439 aa  73.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.67 
 
 		 3227 aa  72.4  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  26.11 
 
 		 3542 aa  71.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  37.72 
 
 		 711 aa  70.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  27.6 
 
 		 2927 aa  70.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1547 aa  70.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1329 aa  70.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  40.66 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  28.9 
 
 		 1602 aa  69.3  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  31.59 
 
 		 1288 aa  68.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.46 
 
 		 3324 aa  68.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.12 
 
 		 4896 aa  68.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  23.89 
 
 		 4071 aa  68.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  39.53 
 
 		 1152 aa  66.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  25.63 
 
 		 4429 aa  66.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  27.65 
 
 		 1463 aa  65.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.84 
 
 		 1620 aa  65.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  26.5 
 
 		 755 aa  65.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  35.14 
 
 		 969 aa  65.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  35.14 
 
 		 963 aa  65.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  31.86 
 
 		 5453 aa  65.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1193 aa  65.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40 
 
 		 2377 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.33 
 
 		 792 aa  64.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1822 aa  63.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  32.03 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  27.12 
 
 		 1748 aa  62.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3602 aa  62.4  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  36.36 
 
 		 581 aa  62  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1829 aa  62  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  31.25 
 
 		 968 aa  61.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1303 aa  60.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3737 aa  60.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  21.47 
 
 		 636 aa  60.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  30.57 
 
 		 815 aa  59.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  35.5 
 
 		 1108 aa  58.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  33.17 
 
 		 365 aa  58.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  30.4 
 
 		 886 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.76 
 
 		 1371 aa  57.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.21 
 
 		 3471 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  28.91 
 
 		 1452 aa  57  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  36.67 
 
 		 615 aa  57  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  31.71 
 
 		 751 aa  56.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  34.62 
 
 		 1295 aa  56.2  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.54 
 
 		 2296 aa  56.2  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  29.71 
 
 		 627 aa  55.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.78 
 
 		 4013 aa  55.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1259 aa  55.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.47 
 
 		 831 aa  54.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  38.21 
 
 		 271 aa  55.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  33.71 
 
 		 735 aa  54.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.97 
 
 		 2281 aa  53.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.52 
 
 		 5745 aa  53.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.65 
 
 		 1345 aa  53.5  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  31.86 
 
 		 2972 aa  53.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  28.33 
 
 		 2416 aa  53.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  29.06 
 
 		 2772 aa  52.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  29.1 
 
 		 1222 aa  52.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  25 
 
 		 1526 aa  52  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 1121 aa  51.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  24.54 
 
 		 2588 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2478 aa  50.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1163 aa  50.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1059 aa  50.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  31.25 
 
 		 750 aa  49.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2487 aa  50.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.21 
 
 		 3191 aa  49.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1032 aa  49.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  31.15 
 
 		 642 aa  49.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.39 
 
 		 1606 aa  49.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>