53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2517 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1263    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  29.15 
 
 		 751 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  25.71 
 
 		 735 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.55 
 
 		 799 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.06 
 
 		 794 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  29.29 
 
 		 822 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  26.47 
 
 		 636 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  26.17 
 
 		 792 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  27.13 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  25.88 
 
 		 969 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  42.22 
 
 		 599 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  36.45 
 
 		 2402 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  36.26 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  38.61 
 
 		 1483 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.42 
 
 		 886 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  25.28 
 
 		 963 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  28.91 
 
 		 637 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  38.75 
 
 		 1152 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  40.91 
 
 		 2270 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1980 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1067 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  31.33 
 
 		 2772 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  38.37 
 
 		 689 aa  54.3  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  38.1 
 
 		 742 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  33.68 
 
 		 750 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 2377 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  28.44 
 
 		 3793 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  32.65 
 
 		 315 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4388  hypothetical protein  25.68 
 
 		 373 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1259 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  32.61 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  32.61 
 
 		 648 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.66 
 
 		 2367 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1313 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  33.66 
 
 		 2421 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.66 
 
 		 2411 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  33.66 
 
 		 2454 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 		 4896 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 3324 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.66 
 
 		 2807 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1193 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.07 
 
 		 3927 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  32.61 
 
 		 815 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  31.25 
 
 		 968 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.61 
 
 		 1230 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.44 
 
 		 3471 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  32.29 
 
 		 950 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2471  hypothetical protein  34.65 
 
 		 836 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3602 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1547 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  27.55 
 
 		 3737 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  30.77 
 
 		 3227 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>