16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1240 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  66.99 
 
 		 711 aa  930    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 717 aa  1416    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1829 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1439 aa  120  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.26 
 
 		 1822 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.86 
 
 		 1800 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1315 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1980 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1439 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  32.33 
 
 		 1716 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1238 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  25.38 
 
 		 631 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  27.93 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  32.17 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.6 
 
 		 5453 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1193 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>