142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3478 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  100 
 
 		 3737 aa  7331    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  43.77 
 
 		 2005 aa  943    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  37.47 
 
 		 4429 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.82 
 
 		 3542 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.86 
 
 		 3793 aa  236  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  29.49 
 
 		 2278 aa  225  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  44.2 
 
 		 3602 aa  196  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1386 aa  140  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  24.81 
 
 		 2270 aa  114  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.07 
 
 		 1483 aa  103  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  25.33 
 
 		 3562 aa  94.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  46.07 
 
 		 3227 aa  93.6  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  31.41 
 
 		 726 aa  91.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 4013 aa  90.1  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  40.35 
 
 		 2927 aa  89.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  28.98 
 
 		 315 aa  88.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  37.72 
 
 		 2296 aa  84  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  29.6 
 
 		 599 aa  84  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  41.41 
 
 		 711 aa  83.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  43.82 
 
 		 1526 aa  83.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  37.68 
 
 		 1066 aa  81.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  40.32 
 
 		 2487 aa  81.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  42.17 
 
 		 1064 aa  80.1  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  27.65 
 
 		 1160 aa  79  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  44.21 
 
 		 1461 aa  77.8  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  24.29 
 
 		 3191 aa  77.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  27.84 
 
 		 707 aa  78.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  37.74 
 
 		 2588 aa  77.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1303 aa  77.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  38.95 
 
 		 750 aa  77  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  38.18 
 
 		 2267 aa  76.6  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  42.53 
 
 		 3324 aa  75.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  42.31 
 
 		 2367 aa  75.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  42.31 
 
 		 2421 aa  75.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  42.31 
 
 		 2411 aa  75.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  36.21 
 
 		 2478 aa  75.1  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.11 
 
 		 2377 aa  75.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  42.31 
 
 		 2454 aa  74.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  40.23 
 
 		 1084 aa  73.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  30.21 
 
 		 1748 aa  73.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  42.31 
 
 		 2807 aa  73.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  36.96 
 
 		 627 aa  73.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  39.09 
 
 		 2602 aa  72.8  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.89 
 
 		 3927 aa  72.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  37.11 
 
 		 4896 aa  72  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  37.89 
 
 		 815 aa  71.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  34.48 
 
 		 2980 aa  70.1  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  37.74 
 
 		 1665 aa  69.7  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  36.56 
 
 		 1371 aa  69.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.68 
 
 		 2772 aa  68.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1139 aa  68.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  33.66 
 
 		 2022 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  31.37 
 
 		 3471 aa  67.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  33.02 
 
 		 2402 aa  67.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  39.42 
 
 		 852 aa  67  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  30.56 
 
 		 871 aa  67  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  38.3 
 
 		 2064 aa  66.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  31.19 
 
 		 2972 aa  66.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1059 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 1162 aa  65.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  30.19 
 
 		 5745 aa  66.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  38.2 
 
 		 676 aa  65.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  36 
 
 		 799 aa  65.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  33.64 
 
 		 429 aa  65.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  35.48 
 
 		 1389 aa  65.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  28.03 
 
 		 989 aa  65.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  35.34 
 
 		 794 aa  64.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  30.36 
 
 		 6497 aa  64.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  34.02 
 
 		 652 aa  63.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 983 aa  63.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1259 aa  62.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  24.55 
 
 		 1068 aa  62.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  37.11 
 
 		 968 aa  62.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  39.02 
 
 		 822 aa  62  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  33.54 
 
 		 907 aa  61.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  33.7 
 
 		 967 aa  60.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1980 aa  60.1  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  34.09 
 
 		 1097 aa  60.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  34.88 
 
 		 774 aa  59.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  32.35 
 
 		 1152 aa  58.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  33.7 
 
 		 581 aa  58.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  32.98 
 
 		 561 aa  58.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  30.71 
 
 		 1222 aa  58.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  35.05 
 
 		 950 aa  58.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.93 
 
 		 808 aa  58.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1313 aa  57.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  39.82 
 
 		 5544 aa  57.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  36.08 
 
 		 3921 aa  57.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.43 
 
 		 540 aa  57.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  29.6 
 
 		 5298 aa  57  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.67 
 
 		 4071 aa  57  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  26.62 
 
 		 3958 aa  56.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1210 aa  56.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1547 aa  56.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  34.88 
 
 		 1345 aa  56.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3747  hypothetical protein  24.47 
 
 		 800 aa  56.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000112576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  25.18 
 
 		 503 aa  55.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23.85 
 
 		 1657 aa  55.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  33.66 
 
 		 969 aa  55.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1245 aa  54.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>