117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1644 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  100 
 
 		 2602 aa  5275    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  51.24 
 
 		 2478 aa  645    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  34.89 
 
 		 1461 aa  665    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  53.01 
 
 		 2267 aa  493  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0183  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 2204 aa  296  4e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  33.6 
 
 		 2487 aa  209  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  35.55 
 
 		 2588 aa  174  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.99 
 
 		 5745 aa  140  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  47.06 
 
 		 3191 aa  120  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  31.42 
 
 		 4978 aa  120  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33 
 
 		 1597 aa  119  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  45.28 
 
 		 1665 aa  106  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.31 
 
 		 2377 aa  105  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  30.64 
 
 		 7149 aa  99.4  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.68 
 
 		 3793 aa  99  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  29.12 
 
 		 1269 aa  96.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.63 
 
 		 4896 aa  95.9  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.85 
 
 		 1268 aa  94  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.61 
 
 		 1269 aa  89.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  29.76 
 
 		 9867 aa  85.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  31.31 
 
 		 3471 aa  85.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  30.16 
 
 		 3927 aa  84  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  36.72 
 
 		 2064 aa  74.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  39.09 
 
 		 3737 aa  73.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  30.71 
 
 		 721 aa  73.2  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  33.7 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.47 
 
 		 1363 aa  72  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  39.58 
 
 		 3602 aa  70.1  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.69 
 
 		 850 aa  70.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.25 
 
 		 4848 aa  69.3  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  37.37 
 
 		 2005 aa  68.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.72 
 
 		 761 aa  68.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.72 
 
 		 994 aa  68.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 4748 aa  68.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.52 
 
 		 4689 aa  67.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  32.67 
 
 		 2022 aa  66.6  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.94 
 
 		 1367 aa  66.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.62 
 
 		 892 aa  65.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.19 
 
 		 2816 aa  65.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  35.37 
 
 		 3477 aa  63.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  38.02 
 
 		 1022 aa  62.8  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.49 
 
 		 3474 aa  62.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  36.13 
 
 		 750 aa  62.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1139 aa  62.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.24 
 
 		 2927 aa  62.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  24.89 
 
 		 1008 aa  62  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.36 
 
 		 2839 aa  62  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.94 
 
 		 3816 aa  61.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  29.66 
 
 		 599 aa  60.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  39.77 
 
 		 2367 aa  59.3  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  39.77 
 
 		 2421 aa  59.3  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  39.77 
 
 		 2411 aa  59.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.6 
 
 		 3363 aa  59.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.68 
 
 		 4220 aa  58.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.32 
 
 		 4122 aa  58.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.79 
 
 		 3227 aa  58.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1059 aa  58.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  39.77 
 
 		 2454 aa  58.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  39.77 
 
 		 2807 aa  58.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.22 
 
 		 4836 aa  58.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  32.81 
 
 		 594 aa  57.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.68 
 
 		 8321 aa  57  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.88 
 
 		 1483 aa  57  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  35.25 
 
 		 4854 aa  56.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.29 
 
 		 1287 aa  55.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  37 
 
 		 627 aa  56.2  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  35.42 
 
 		 2772 aa  55.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  35.19 
 
 		 637 aa  55.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.84 
 
 		 2296 aa  55.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  40 
 
 		 3486 aa  55.5  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  29.28 
 
 		 814 aa  54.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  34.62 
 
 		 560 aa  55.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  39.36 
 
 		 1162 aa  54.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.38 
 
 		 2346 aa  54.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  41.3 
 
 		 974 aa  54.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.27 
 
 		 1884 aa  54.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  32.14 
 
 		 822 aa  54.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1259 aa  53.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.16 
 
 		 1371 aa  53.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  28 
 
 		 4013 aa  53.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.61 
 
 		 2270 aa  52.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 3333 aa  52.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  28.57 
 
 		 1215 aa  50.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  26.11 
 
 		 871 aa  50.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  32.65 
 
 		 998 aa  50.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  26.24 
 
 		 1911 aa  50.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  28.57 
 
 		 1215 aa  50.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 1526 aa  50.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.43 
 
 		 3089 aa  50.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.71 
 
 		 1706 aa  50.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2196  hemolysin-type calcium-binding region  23.78 
 
 		 15245 aa  50.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.81 
 
 		 2812 aa  50.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  36.36 
 
 		 676 aa  48.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.46 
 
 		 794 aa  49.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  32.63 
 
 		 1389 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1126 aa  48.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2476 aa  48.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.59 
 
 		 369 aa  48.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.95 
 
 		 1215 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  30.6 
 
 		 1394 aa  48.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>