107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0530 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  100 
 
 		 1210 aa  2445    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  48.1 
 
 		 1032 aa  325  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.17 
 
 		 1019 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  27.3 
 
 		 1527 aa  84.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.41 
 
 		 2194 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.99 
 
 		 1009 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  26.78 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.02 
 
 		 2377 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.49 
 
 		 889 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  34.4 
 
 		 3793 aa  69.3  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1289 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.7 
 
 		 1118 aa  68.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.58 
 
 		 3227 aa  68.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  28.83 
 
 		 1526 aa  68.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.25 
 
 		 3927 aa  68.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27 
 
 		 1340 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.33 
 
 		 4379 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.54 
 
 		 1222 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.35 
 
 		 1225 aa  65.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  26.14 
 
 		 974 aa  64.7  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.69 
 
 		 2807 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  23.97 
 
 		 1838 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  24.21 
 
 		 1490 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  26.04 
 
 		 412 aa  63.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.66 
 
 		 1113 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  35.59 
 
 		 2270 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  38.82 
 
 		 315 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  25.81 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.69 
 
 		 2296 aa  60.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.9 
 
 		 3471 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2927 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1547 aa  58.9  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.55 
 
 		 1126 aa  57.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.77 
 
 		 959 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  22.86 
 
 		 644 aa  57.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1259 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  34.48 
 
 		 3737 aa  56.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  33.67 
 
 		 1483 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  24.67 
 
 		 1124 aa  55.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  24.43 
 
 		 872 aa  55.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1067 aa  55.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  31.13 
 
 		 9867 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  22.38 
 
 		 485 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  28.21 
 
 		 2367 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  28.21 
 
 		 2421 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  28.21 
 
 		 2454 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  22.85 
 
 		 2807 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  28.21 
 
 		 2411 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  24.29 
 
 		 1557 aa  53.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  23.5 
 
 		 437 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  22.01 
 
 		 4896 aa  53.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  26.09 
 
 		 2478 aa  53.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  30 
 
 		 711 aa  53.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  21.76 
 
 		 794 aa  52.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1066 aa  52.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1064 aa  52.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  29.29 
 
 		 599 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  28.89 
 
 		 750 aa  52  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  29.57 
 
 		 1022 aa  52.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  23.6 
 
 		 1275 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1059 aa  52  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  24.01 
 
 		 523 aa  51.6  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.61 
 
 		 1012 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  29.47 
 
 		 1152 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  36 
 
 		 852 aa  51.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.24 
 
 		 469 aa  50.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  29.17 
 
 		 689 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.39 
 
 		 891 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.52 
 
 		 1228 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  40.3 
 
 		 3542 aa  50.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  29.13 
 
 		 2772 aa  50.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.52 
 
 		 1246 aa  49.7  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.6 
 
 		 813 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.86 
 
 		 627 aa  49.3  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  30.37 
 
 		 886 aa  49.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  34.83 
 
 		 3324 aa  49.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2005 aa  48.9  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 404 aa  48.5  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.93 
 
 		 616 aa  48.5  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  35.44 
 
 		 496 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1980 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  35.62 
 
 		 3602 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  23.79 
 
 		 437 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  30.3 
 
 		 963 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  30.3 
 
 		 969 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.93 
 
 		 822 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1127 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  24.74 
 
 		 2267 aa  47.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  21.99 
 
 		 506 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  24.64 
 
 		 494 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  25 
 
 		 604 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30 
 
 		 1313 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  33.73 
 
 		 2402 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.8 
 
 		 1114 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.19 
 
 		 868 aa  46.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  24.79 
 
 		 3197 aa  46.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.42 
 
 		 8871 aa  45.8  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  25.82 
 
 		 554 aa  45.8  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.3 
 
 		 1094 aa  45.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  32.22 
 
 		 161 aa  45.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>