42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0835 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  100 
 
 		 1084 aa  2141    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  41.7 
 
 		 1184 aa  735    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  53.43 
 
 		 1046 aa  714    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  51.01 
 
 		 1331 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  55.43 
 
 		 909 aa  750    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  42.37 
 
 		 2416 aa  508  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  31.12 
 
 		 2650 aa  175  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  32.59 
 
 		 1053 aa  161  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1051 aa  160  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  42.77 
 
 		 726 aa  104  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 		 4429 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  25 
 
 		 1436 aa  83.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  38.93 
 
 		 3737 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34.11 
 
 		 3542 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1021 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  33.08 
 
 		 1288 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  36.04 
 
 		 1748 aa  61.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1351 aa  60.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  31.31 
 
 		 2278 aa  59.3  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1303 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  31.85 
 
 		 3793 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  33.18 
 
 		 1295 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.26 
 
 		 4978 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1280 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  30.89 
 
 		 2713 aa  55.8  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.39 
 
 		 2270 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1083 aa  54.3  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  33.55 
 
 		 1414 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  45.33 
 
 		 707 aa  52  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1386 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  29.18 
 
 		 1266 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1329 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  26.07 
 
 		 3324 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1114 aa  48.9  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  29.38 
 
 		 1247 aa  48.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1054 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  40 
 
 		 2418 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.08 
 
 		 1657 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.81 
 
 		 991 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  34.9 
 
 		 1108 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.61 
 
 		 989 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  45.83 
 
 		 5544 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>