43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0808 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  83.77 
 
 
1021 aa  907    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  65.04 
 
 
1351 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  100 
 
 
1436 aa  2876    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  42.22 
 
 
1114 aa  576  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  43.75 
 
 
1280 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2703  hypothetical protein  47.53 
 
 
277 aa  246  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0106658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3818  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3108  hypothetical protein  50.21 
 
 
278 aa  242  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  35.64 
 
 
4978 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  27.35 
 
 
909 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3296  hypothetical protein  26.26 
 
 
599 aa  119  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  25.56 
 
 
1184 aa  108  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  30.35 
 
 
2807 aa  104  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  26.16 
 
 
1331 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  28.71 
 
 
2421 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  28.9 
 
 
2454 aa  96.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  27.06 
 
 
1046 aa  93.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  25.16 
 
 
1084 aa  89.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.43 
 
 
2411 aa  85.5  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  29.43 
 
 
2367 aa  85.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  30.54 
 
 
1976 aa  83.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  28.93 
 
 
976 aa  75.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  26.74 
 
 
2418 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.88 
 
 
1259 aa  66.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08596  hypothetical protein  24.37 
 
 
659 aa  64.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.53584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.66 
 
 
4896 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  23.86 
 
 
2416 aa  63.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  33.16 
 
 
707 aa  59.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  24.14 
 
 
1170 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  25.14 
 
 
1051 aa  56.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  24.26 
 
 
1053 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  33.71 
 
 
4071 aa  55.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  25.74 
 
 
2772 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  23.3 
 
 
1133 aa  50.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  27.75 
 
 
953 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  28.46 
 
 
2831 aa  47.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 
1283 aa  46.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  33.81 
 
 
2833 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.03 
 
 
1212 aa  45.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  30.59 
 
 
532 aa  45.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  24.56 
 
 
2650 aa  45.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.08 
 
 
1217 aa  45.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.68 
 
 
1292 aa  45.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>