154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4166 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  100 
 
 		 2833 aa  5693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  56.38 
 
 		 4071 aa  2225    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  34.19 
 
 		 541 aa  239  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  35.68 
 
 		 2588 aa  188  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1287 aa  173  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  30.14 
 
 		 3602 aa  163  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  29.97 
 
 		 496 aa  156  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  35.61 
 
 		 1008 aa  133  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.98 
 
 		 2270 aa  124  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  31.27 
 
 		 938 aa  124  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.8 
 
 		 1222 aa  121  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1547 aa  120  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1488 aa  119  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1313 aa  119  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  29.21 
 
 		 886 aa  117  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.11 
 
 		 3682 aa  113  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.92 
 
 		 890 aa  113  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  30.54 
 
 		 1987 aa  112  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  28.9 
 
 		 657 aa  110  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  28.28 
 
 		 648 aa  108  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  26.47 
 
 		 3851 aa  107  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.68 
 
 		 4978 aa  106  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  29.77 
 
 		 2344 aa  106  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1245 aa  105  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1634 aa  104  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  29.6 
 
 		 3089 aa  102  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  98.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  30.8 
 
 		 581 aa  97.1  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.98 
 
 		 1345 aa  96.7  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  42.05 
 
 		 535 aa  87  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.62 
 
 		 1620 aa  86.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  37.31 
 
 		 1140 aa  86.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  42.27 
 
 		 532 aa  85.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  33.03 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  30.99 
 
 		 2411 aa  81.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  30.99 
 
 		 2367 aa  80.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  27.22 
 
 		 6497 aa  80.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  24.11 
 
 		 1068 aa  80.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  23.41 
 
 		 1606 aa  79.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  38.18 
 
 		 677 aa  79.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  29.18 
 
 		 662 aa  79.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  39.77 
 
 		 540 aa  79  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  34.88 
 
 		 2807 aa  78.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.7 
 
 		 3793 aa  78.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.02 
 
 		 650 aa  78.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  39.77 
 
 		 534 aa  78.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  30.89 
 
 		 1108 aa  77.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  26.42 
 
 		 652 aa  77.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.15 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  27.96 
 
 		 1230 aa  76.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  34.23 
 
 		 496 aa  75.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  26.08 
 
 		 749 aa  75.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.86 
 
 		 989 aa  75.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  26.14 
 
 		 998 aa  75.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  25.74 
 
 		 815 aa  74.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  40.91 
 
 		 3542 aa  73.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1976 aa  73.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  37.61 
 
 		 953 aa  73.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1163 aa  72  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  27.44 
 
 		 1152 aa  71.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  34.09 
 
 		 2421 aa  70.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  34.09 
 
 		 2454 aa  70.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  38 
 
 		 2980 aa  70.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  28.98 
 
 		 1602 aa  70.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  29.15 
 
 		 885 aa  70.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  24.09 
 
 		 561 aa  68.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  39.77 
 
 		 808 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.16 
 
 		 4896 aa  68.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  35.96 
 
 		 503 aa  68.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  36.89 
 
 		 1466 aa  67.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  28.99 
 
 		 967 aa  66.6  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.5 
 
 		 2377 aa  66.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.98 
 
 		 1371 aa  66.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  36.29 
 
 		 950 aa  65.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  35.63 
 
 		 429 aa  65.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  34.82 
 
 		 4429 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.51 
 
 		 3927 aa  64.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  34.68 
 
 		 968 aa  64.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  30.54 
 
 		 742 aa  63.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  27.93 
 
 		 2402 aa  63.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  40.91 
 
 		 2972 aa  63.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  34.65 
 
 		 969 aa  62.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.35 
 
 		 822 aa  62.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1064 aa  62.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  34.25 
 
 		 726 aa  62.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  34.65 
 
 		 963 aa  61.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1067 aa  62  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  25.94 
 
 		 797 aa  62  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  30.98 
 
 		 2487 aa  61.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.72 
 
 		 1463 aa  62  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  25 
 
 		 774 aa  61.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  26.47 
 
 		 1247 aa  60.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  30.91 
 
 		 991 aa  60.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.66 
 
 		 1657 aa  60.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.08 
 
 		 1288 aa  60.1  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  35.37 
 
 		 636 aa  59.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  31.61 
 
 		 2239 aa  59.3  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  42.67 
 
 		 676 aa  59.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  31.47 
 
 		 976 aa  59.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  33.81 
 
 		 1436 aa  59.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>