126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1799 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  100 
 
 		 742 aa  1530    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  29.26 
 
 		 648 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  28.94 
 
 		 657 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  31.79 
 
 		 1222 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.07 
 
 		 938 aa  94.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1488 aa  92.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  28.14 
 
 		 561 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  38.97 
 
 		 2402 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.5 
 
 		 581 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.49 
 
 		 2270 aa  80.9  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  36.61 
 
 		 3227 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1313 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1245 aa  74.3  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2757  hypothetical protein  24.92 
 
 		 623 aa  73.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0366387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  25.39 
 
 		 1152 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  43.02 
 
 		 2377 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1980 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1111 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  25.97 
 
 		 636 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  25.54 
 
 		 496 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1067 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  39.13 
 
 		 1483 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  34.62 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  38.39 
 
 		 4896 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  52.38 
 
 		 3793 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1064 aa  68.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27 
 
 		 1547 aa  67.8  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  37.65 
 
 		 599 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  26.98 
 
 		 652 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  39.78 
 
 		 3737 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  29.95 
 
 		 989 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.63 
 
 		 4071 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40.51 
 
 		 3324 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  42.35 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  23.79 
 
 		 1389 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1287 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.54 
 
 		 2833 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  43.08 
 
 		 3471 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  44.29 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  42.5 
 
 		 3927 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3837  hypothetical protein  28.85 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  27.67 
 
 		 2267 aa  60.1  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  34.86 
 
 		 1140 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  38.1 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  30.86 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29 
 
 		 2296 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  37.21 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  27.35 
 
 		 749 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.23 
 
 		 2713 aa  58.9  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  24.91 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1461 aa  57.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  31.45 
 
 		 968 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  30.99 
 
 		 750 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  34.88 
 
 		 1526 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  27.61 
 
 		 532 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.18 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2471  hypothetical protein  32.03 
 
 		 836 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  35.37 
 
 		 735 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  38.36 
 
 		 5745 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  31.45 
 
 		 950 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  30.63 
 
 		 822 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  32.63 
 
 		 2807 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.4 
 
 		 2927 aa  54.7  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  23.55 
 
 		 2972 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  33.57 
 
 		 885 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.63 
 
 		 2367 aa  54.3  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.63 
 
 		 2411 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1059 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  32.63 
 
 		 2421 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.09 
 
 		 5453 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  33.72 
 
 		 3602 aa  54.3  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.86 
 
 		 1068 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  32.63 
 
 		 2454 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  22.18 
 
 		 2772 aa  54.3  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  25.37 
 
 		 1463 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1179  hypothetical protein  26.78 
 
 		 603 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.952655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  24.76 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  30.69 
 
 		 792 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  28.81 
 
 		 2478 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.07 
 
 		 1345 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  30.43 
 
 		 2005 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  23.31 
 
 		 890 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  38.1 
 
 		 676 aa  52.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  37.88 
 
 		 640 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  30.27 
 
 		 2588 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.76 
 
 		 815 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1066 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  27.57 
 
 		 1230 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  24.83 
 
 		 886 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  25.66 
 
 		 774 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.96 
 
 		 1620 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  24.64 
 
 		 1602 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.07 
 
 		 627 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1259 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25 
 
 		 1466 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.96 
 
 		 1371 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1210 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1100 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  25.96 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  38.67 
 
 		 4013 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>