223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1162 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  100 
 
 		 991 aa  1971    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  55.94 
 
 		 1266 aa  616  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  47.77 
 
 		 1288 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  63.17 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  40.75 
 
 		 1657 aa  301  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  42.71 
 
 		 3793 aa  254  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  37.68 
 
 		 1108 aa  252  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  45.66 
 
 		 1748 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  41.63 
 
 		 1414 aa  221  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  42.03 
 
 		 815 aa  207  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  34.75 
 
 		 554 aa  197  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  39.55 
 
 		 486 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  45.86 
 
 		 1247 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  39.44 
 
 		 2270 aa  171  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1329 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  36.63 
 
 		 2713 aa  162  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  44.66 
 
 		 1474 aa  161  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  43.37 
 
 		 1585 aa  155  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  43.37 
 
 		 1217 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  37.79 
 
 		 482 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  39.06 
 
 		 1160 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  36.34 
 
 		 1275 aa  146  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  30.19 
 
 		 5453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  36.07 
 
 		 317 aa  143  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  34.7 
 
 		 1152 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  31.88 
 
 		 365 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.42 
 
 		 1547 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  41.2 
 
 		 1002 aa  118  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.52 
 
 		 1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  33 
 
 		 402 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  33.02 
 
 		 327 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  31.18 
 
 		 405 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  33.66 
 
 		 385 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  32.9 
 
 		 326 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  30.46 
 
 		 594 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  31.23 
 
 		 397 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  31.65 
 
 		 380 aa  106  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  28.72 
 
 		 989 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.3 
 
 		 4429 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  34.39 
 
 		 522 aa  98.2  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  31.4 
 
 		 436 aa  98.2  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  30.84 
 
 		 527 aa  97.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  30.41 
 
 		 1295 aa  95.1  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  29.51 
 
 		 375 aa  94.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  28.3 
 
 		 449 aa  94  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  28.69 
 
 		 346 aa  92.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  31.15 
 
 		 822 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  27.48 
 
 		 435 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.33 
 
 		 1607 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  32.3 
 
 		 327 aa  89.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  52.58 
 
 		 1362 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1969 aa  87.8  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1287 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.26 
 
 		 1507 aa  87  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  30.09 
 
 		 6497 aa  86.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  26.74 
 
 		 890 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1386 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  34.48 
 
 		 2262 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  29.92 
 
 		 730 aa  84  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1406 aa  82.8  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  27.13 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.75 
 
 		 792 aa  81.6  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1313 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 922 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  27.79 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.84 
 
 		 1602 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.53 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  29.13 
 
 		 925 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.9 
 
 		 984 aa  78.2  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  31.38 
 
 		 4071 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  31.73 
 
 		 1170 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  27.57 
 
 		 456 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  42.71 
 
 		 1051 aa  77  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.96 
 
 		 915 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  45.65 
 
 		 1285 aa  75.1  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  27.85 
 
 		 799 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  42.55 
 
 		 1132 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1488 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  26.32 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  31.14 
 
 		 1152 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.15 
 
 		 1750 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29 
 
 		 2402 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  38.41 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  31.03 
 
 		 335 aa  72  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  42.15 
 
 		 1054 aa  72  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  36.29 
 
 		 1123 aa  71.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  29.34 
 
 		 427 aa  71.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  24.67 
 
 		 686 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 3324 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1100 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  23.26 
 
 		 351 aa  70.1  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.5 
 
 		 3542 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  27.21 
 
 		 769 aa  69.3  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.36 
 
 		 703 aa  68.9  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  26.04 
 
 		 1316 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  24.06 
 
 		 794 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  39.2 
 
 		 846 aa  68.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1064 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1139 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.63 
 
 		 979 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>