114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1720 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  100 
 
 
726 aa  1478    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  34.04 
 
 
774 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  35.81 
 
 
766 aa  148  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  34.04 
 
 
1097 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  42.65 
 
 
6678 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  33.58 
 
 
873 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  41.98 
 
 
2364 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  41.98 
 
 
860 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  26.83 
 
 
4429 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  35.82 
 
 
6497 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  37.33 
 
 
3562 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  47.87 
 
 
1634 aa  96.3  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  42.34 
 
 
5298 aa  90.5  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  23.95 
 
 
1547 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  40.7 
 
 
1084 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  26.7 
 
 
1371 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  25.55 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  36.11 
 
 
3958 aa  81.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.14 
 
 
3542 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  36.04 
 
 
822 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  29.07 
 
 
815 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  28.23 
 
 
792 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  26.89 
 
 
4044 aa  74.3  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  31.41 
 
 
3737 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.11 
 
 
3227 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
2927 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  25.38 
 
 
1389 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  43.14 
 
 
3325 aa  65.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  32.22 
 
 
1066 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  30.59 
 
 
1139 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  34.57 
 
 
1526 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30 
 
 
2296 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  32.56 
 
 
637 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  34.38 
 
 
5769 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  28.95 
 
 
1266 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  26.11 
 
 
496 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  34.25 
 
 
2833 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  22.14 
 
 
1059 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.43 
 
 
2270 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  28.37 
 
 
885 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  23.53 
 
 
1064 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  23.72 
 
 
561 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  31.25 
 
 
1162 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  32.95 
 
 
799 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  34.52 
 
 
794 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  25.8 
 
 
652 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  35.04 
 
 
2278 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  39.02 
 
 
4071 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  24.43 
 
 
503 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.45 
 
 
1602 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  24.8 
 
 
535 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  27.37 
 
 
2005 aa  54.7  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  33.7 
 
 
1140 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  21.33 
 
 
532 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  28.47 
 
 
1657 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.53 
 
 
1414 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.21 
 
 
1222 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  32.08 
 
 
1160 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  31.08 
 
 
874 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  31.71 
 
 
1193 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  23.45 
 
 
1313 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  32.69 
 
 
871 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  27.66 
 
 
429 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  24 
 
 
534 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  37.33 
 
 
1287 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  32.18 
 
 
2980 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  32.86 
 
 
1259 aa  51.2  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  24.81 
 
 
2402 aa  51.2  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  28.57 
 
 
2064 aa  50.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  23.35 
 
 
886 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  32.43 
 
 
750 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  23.66 
 
 
967 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  20.22 
 
 
2972 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  22.42 
 
 
541 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  24.8 
 
 
540 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  23.21 
 
 
490 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  27.68 
 
 
636 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  23.58 
 
 
938 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.08 
 
 
4896 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  35.21 
 
 
3793 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.21 
 
 
2377 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  30.49 
 
 
676 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  28.99 
 
 
1230 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  29.63 
 
 
3602 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.4 
 
 
1620 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  27.08 
 
 
2454 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  25.27 
 
 
711 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  28.74 
 
 
2367 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.96 
 
 
2421 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  25.97 
 
 
2772 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  28.74 
 
 
2411 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  27.27 
 
 
2487 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  30.28 
 
 
5544 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  25.51 
 
 
1488 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.08 
 
 
2807 aa  47.4  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.05 
 
 
991 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  36.76 
 
 
1466 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  23.01 
 
 
648 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  28.89 
 
 
658 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  26.97 
 
 
315 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>