61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06065 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1789    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  34.12 
 
 		 766 aa  175  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  25.03 
 
 		 797 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  31.65 
 
 		 938 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  33.52 
 
 		 774 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  28.75 
 
 		 860 aa  126  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  28.75 
 
 		 2364 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  33.58 
 
 		 726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 		 1097 aa  120  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  29.48 
 
 		 1222 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  48.89 
 
 		 1634 aa  87.4  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1030 aa  82.4  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  35 
 
 		 6497 aa  82.4  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  37.17 
 
 		 3958 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  29.55 
 
 		 4044 aa  74.3  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  35.66 
 
 		 5298 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  30.25 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.63 
 
 		 1371 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.73 
 
 		 3227 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  25.85 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  23.63 
 
 		 636 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1064 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  27.12 
 
 		 503 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  22.69 
 
 		 535 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.33 
 
 		 429 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.36 
 
 		 1162 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  24.05 
 
 		 532 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  32 
 
 		 694 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1139 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  21.9 
 
 		 561 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1059 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  31.82 
 
 		 3737 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1488 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.12 
 
 		 2927 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  28.28 
 
 		 1140 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  28.16 
 
 		 815 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  34.07 
 
 		 711 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  24.77 
 
 		 1389 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1313 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  27.93 
 
 		 2262 aa  48.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  37.88 
 
 		 1066 aa  47.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  26.38 
 
 		 886 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2047  hypothetical protein  29.29 
 
 		 354 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.697732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1193 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.6 
 
 		 822 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  22.56 
 
 		 799 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.19 
 
 		 2402 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  31.03 
 
 		 1230 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.35 
 
 		 2296 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1245 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1259 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.57 
 
 		 794 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1547 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  36.59 
 
 		 2980 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  26.25 
 
 		 1987 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  41.07 
 
 		 406 aa  45.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  30.09 
 
 		 534 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  30.21 
 
 		 792 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  27.62 
 
 		 2005 aa  44.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  23.85 
 
 		 3851 aa  44.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1287 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>