109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3959 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  100 
 
 		 1066 aa  2150    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  81.65 
 
 		 2927 aa  204  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3946  hypothetical protein  34.61 
 
 		 555 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  33.67 
 
 		 739 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  33.5 
 
 		 739 aa  178  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  33.05 
 
 		 767 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  31.8 
 
 		 718 aa  172  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  66.97 
 
 		 2296 aa  170  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  31.69 
 
 		 757 aa  163  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  64.49 
 
 		 1526 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07279  GPI anchored protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01300)  32.65 
 
 		 387 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  29.86 
 
 		 741 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  29.59 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  29.59 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  52.63 
 
 		 3227 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1017  protein of unknown function DUF1080  29.41 
 
 		 786 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0838366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0704  16S rRNA dimethylase  25.12 
 
 		 675 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3960  hypothetical protein  29.44 
 
 		 405 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698754  normal  0.0204382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1754  hypothetical protein  29.71 
 
 		 386 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.89 
 
 		 1371 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0899  hypothetical protein  41.55 
 
 		 155 aa  88.6  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.92 
 
 		 834 aa  85.9  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  31.3 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  37.68 
 
 		 3737 aa  81.6  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  40.57 
 
 		 3602 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  40.66 
 
 		 2772 aa  79  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  39.56 
 
 		 750 aa  78.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1064 aa  78.2  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1259 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1059 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  35.63 
 
 		 1389 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2760  hypothetical protein  27.72 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.120597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  37.78 
 
 		 2421 aa  74.7  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.93 
 
 		 2367 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  37.78 
 
 		 2454 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.93 
 
 		 2411 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  37.78 
 
 		 2807 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03486  conserved hypothetical protein  25.63 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  37.76 
 
 		 2005 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  37.63 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  36.94 
 
 		 822 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  39.77 
 
 		 561 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  31.94 
 
 		 1162 aa  70.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  40.48 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1547 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.74 
 
 		 4896 aa  68.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  32.22 
 
 		 726 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  40.66 
 
 		 2064 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 792 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.63 
 
 		 637 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1193 aa  65.1  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 599 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1461 aa  64.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1139 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  30 
 
 		 1032 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  36.47 
 
 		 315 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  27.45 
 
 		 774 aa  60.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.59 
 
 		 847 aa  60.1  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  36.36 
 
 		 711 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.82 
 
 		 3191 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  36.67 
 
 		 2377 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  28.03 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  39.44 
 
 		 1483 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  30.11 
 
 		 1097 aa  58.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  42.86 
 
 		 852 aa  58.5  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  34.67 
 
 		 6497 aa  58.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  31.25 
 
 		 794 aa  58.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  37.84 
 
 		 3958 aa  57.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  29.13 
 
 		 5298 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  34.09 
 
 		 871 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  30.34 
 
 		 429 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  32.26 
 
 		 3324 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  36.62 
 
 		 2364 aa  55.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 		 3471 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  37 
 
 		 2267 aa  55.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  36.62 
 
 		 860 aa  55.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  32.43 
 
 		 3793 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  35.87 
 
 		 2022 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  29.86 
 
 		 2588 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  35.64 
 
 		 244 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34 
 
 		 3927 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  38.24 
 
 		 886 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1210 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  32.99 
 
 		 1466 aa  52  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  36.3 
 
 		 1973 aa  52  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  38.57 
 
 		 766 aa  52  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  33.01 
 
 		 2487 aa  52  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1100 aa  51.6  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  32.32 
 
 		 636 aa  51.6  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1634 aa  51.6  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  28.95 
 
 		 4044 aa  51.6  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.96 
 
 		 5745 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  42.5 
 
 		 603 aa  50.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  36.59 
 
 		 2478 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.58 
 
 		 885 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1665 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  36.62 
 
 		 967 aa  49.3  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  33.02 
 
 		 1152 aa  48.9  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  34.92 
 
 		 642 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  37.88 
 
 		 873 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>